RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	TRDN	Q13061	729 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	CAMK1	Q14012	370 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	GRIK4	Q16099	956 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	IER5	Q5VY09	327 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	MTMR8	Q96EF0	704 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	LNPK	Q9C0E8	428 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1B0GTH6	734 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	CDC14C	A4D256	554 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	PER2	O15055	1255 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	F11	P03951	625 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	AVPR2	P30518	371 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	MGAT3	Q09327	533 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	PAK2	Q13177	524 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	NEK1	Q96PY6	1258 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	FSD2	A1L4K1	749 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511		A6NJY4	79 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511		H0Y858	1186 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	HIP1	O00291	1037 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	CDK2AP1	O14519	115 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	GLP2R	O95838	553 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	SCG2	P13521	617 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXK2	Q01167	660 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	CDHR1	Q96JP9	859 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	TLR9	Q9NR96	1032 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	GATM	P50440	423 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	GRM4	Q14833	912 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	PTPN21	Q16825	1174 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	C4orf17	Q53FE4	359 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	AZI2	Q9H6S1	392 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF358	Q9NW07	568 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	PADI3	Q9ULW8	664 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	GINS2	Q9Y248	185 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	MYH6	P13533	1939 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	TEC	P42680	631 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	PHKA2	P46019	1235 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	CLDN10	P78369	228 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE3A	Q05086	875 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	SEC23A	Q15436	765 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	12.4	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	GPRASP2	Q96D09	838 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	ASIC4	Q96FT7	647 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	APOL5	Q9BWW9	433 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	C5orf42	Q9H799	3197 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SKAP2-209	ENST00000497511	DENND3	A2RUS2	1198 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	12.39	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	CYTH3	O43739	400 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	INSRR	P14616	1297 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	12.39	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	MTMR1	Q13613	665 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	WTAP	Q15007	396 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	DUSP6	Q16828	381 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		12.39	□□□□□ -0.43

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