RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492275.5

TTC3-223, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 3

Gene TTC3, Length 769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-223	ENST00000492275	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	RNF149	Q8NC42	400 aa		28.66	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	LRRC15	Q8TF66	581 aa		28.66	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		28.66	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	TCHH	Q07283	1943 aa		28.66	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	YEATS4	O95619	227 aa		28.65	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	CAPS	Q13938	189 aa		28.65	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275		Q7L0L9	218 aa		28.65	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		28.65	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	ADAM2	Q99965	735 aa		28.65	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		28.65	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	28.65	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		28.65	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	POLD4	Q9HCU8	107 aa		28.65	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	SPTLC2	O15270	562 aa		28.64	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	TLL1	O43897	1013 aa		28.64	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	UPP2	O95045	317 aa		28.64	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		28.64	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	ATL3	Q6DD88	541 aa		28.64	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		28.64	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	CALML4	Q96GE6	196 aa		28.64	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	28.64	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	RGS18	Q9NS28	235 aa		28.64	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	SZT2	Q5T011	3432 aa		28.63	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	PPP6R2	O75170	966 aa		28.63	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	PTEN	P60484	403 aa		28.63	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	POU5F1B	Q06416	359 aa		28.63	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		28.63	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		28.63	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		28.63	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	RAD9A	Q99638	391 aa		28.63	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		28.63	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		28.63	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	ARHGEF15	O94989	841 aa		28.62	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	PLA2G4B	P0C869	781 aa		28.62	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	SLC12A3	P55017	1021 aa		28.62	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	TFDP1	Q14186	410 aa		28.62	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	BSND	Q8WZ55	320 aa		28.62	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		28.62	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	MYO9B	Q13459	2157 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	DENND3	A2RUS2	1198 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	LCHN	A4D1U4	455 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275		C9IYK1	514 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	CA3	P07451	260 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	PLCG1	P19174	1290 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	28.61	■■■□□ 2.17	5e-8	■■■□□ 17.3
TTC3-223	ENST00000492275	DDIT3	P35638	169 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	DEFB123	Q8N688	67 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF576	Q9H609	170 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	MYH11	P35749	1972 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	28.6	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	PHKA2	P46019	1235 aa		28.6	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	FAM189B	P81408	668 aa		28.6	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		28.6	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	FAM161B	Q96MY7	647 aa		28.6	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	CFAP45	Q9UL16	551 aa		28.6	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	INSL6	Q9Y581	213 aa		28.6	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	DAW1	Q8N136	415 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	CHST12	Q9NRB3	414 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		28.58	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	MAPK7	Q13164	816 aa		28.58	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		28.58	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		28.58	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	RAD54L	Q92698	747 aa		28.58	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	KIFAP3	Q92845	792 aa		28.58	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		28.58	■■■□□ 2.17
TTC3-223	ENST00000492275	COL4A6	Q14031	1691 aa		28.58	■■■□□ 2.16
TTC3-223	ENST00000492275	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		28.57	■■■□□ 2.16
TTC3-223	ENST00000492275	HIP1R	O75146	1068 aa		28.57	■■■□□ 2.16
TTC3-223	ENST00000492275	GUCY2C	P25092	1073 aa		28.57	■■■□□ 2.16
TTC3-223	ENST00000492275	TAP1	Q03518	808 aa		28.57	■■■□□ 2.16
TTC3-223	ENST00000492275	MCM6	Q14566	821 aa		28.57	■■■□□ 2.16
TTC3-223	ENST00000492275	ARSH	Q5FYA8	562 aa		28.57	■■■□□ 2.16
TTC3-223	ENST00000492275	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
TTC3-223	ENST00000492275	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
TTC3-223	ENST00000492275	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		28.57	■■■□□ 2.16
TTC3-223	ENST00000492275	YME1L1	Q96TA2	773 aa		28.57	■■■□□ 2.16
TTC3-223	ENST00000492275	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		28.57	■■■□□ 2.16
TTC3-223	ENST00000492275	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		28.57	■■■□□ 2.16
TTC3-223	ENST00000492275	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		28.56	■■■□□ 2.16
TTC3-223	ENST00000492275	CUTA	O60888	179 aa		28.56	■■■□□ 2.16
TTC3-223	ENST00000492275	DGKI	O75912	1065 aa		28.56	■■■□□ 2.16
TTC3-223	ENST00000492275	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	28.56	■■■□□ 2.16

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