RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 MORC4Q8TE76 937 aa18.27■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 EFCC1Q9HA90 598 aa18.27■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 AGBL3Q8NEM8 1001 aa18.27■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa18.27■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 USH1CQ9Y6N9 552 aa18.27■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 MYBL1P10243 752 aa18.27■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 STAT5BP51692 787 aa18.27■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 COG7P83436 770 aa18.27■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 XKR3Q5GH77 459 aa18.27■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 FMO2Q99518 471 aa18.27■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 KIF9Q9HAQ2 790 aa18.27■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 HACL1Q9UJ83 578 aa18.27■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 EVI5O60447 810 aa18.26■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 NDUFAF2Q8N183 169 aa18.26■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 DGAT1O75907 488 aa18.26■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 PRR29P0C7W0 189 aa18.26■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa18.26■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 MT-ND3P03897 115 aa18.26■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 KRT3P12035 628 aa18.26■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 RASA1P20936 1047 aa18.26■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 UBE4BO95155 1302 aa18.26■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 ARHGAP42A6NI28 874 aa18.26■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 SART1O43290 800 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 HIP1RO75146 1068 aa18.26■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 YWHABP31946 246 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 PPP4CP60510 307 aa18.26■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 NAA25Q14CX7 972 aa18.26■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa18.26■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 ZBED2Q9BTP6 218 aa18.26■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 GUCY1A2P33402 732 aa18.25■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 SNAPC2Q13487 334 aa18.25■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 PARD6BQ9BYG5 372 aa18.25■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 ELP3Q9H9T3 547 aa18.25■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 PP2D1A8MPX8 630 aa18.25■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 TXNP10599 105 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 CCDC38Q502W7 563 aa18.25■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 STAP1Q9ULZ2 295 aa18.25■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 MAFGO15525 162 aa18.25■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 FGGP02679 453 aa18.25■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 NUDCD1Q96RS6 583 aa18.25■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 KLC2Q9H0B6 622 aa18.25■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 MMP14P50281 582 aa18.25■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 EPHB1P54762 984 aa18.25■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 DUOXA2Q1HG44 320 aa18.25■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 ZNF394Q53GI3 561 aa18.25■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 XRRA1Q6P2D8 792 aa18.25■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 ZWILCHQ9H900 591 aa18.25■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 SLC25A27O95847 323 aa18.24■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 ZNF560Q96MR9 790 aa18.24■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 IQSEC2Q5JU85 1478 aa18.24■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 CCDC197Q8NCU1 140 aa18.24■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa18.24■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 ZDHHC9Q9Y397 364 aa18.24■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 SMIM5Q71RC9 77 aa18.24■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 PCGF5Q86SE9 256 aa18.24■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 PRR12Q9ULL5 1215 aa18.24■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa18.24■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 CDO1Q16878 200 aa18.24■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 FBXL13Q8NEE6 735 aa18.24■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 TRIM62Q9BVG3 475 aa18.24■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 PSMD14O00487 310 aa18.23■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 PALMO75781 387 aa18.23■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 PDHBP11177 359 aa18.23■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 KCTD16Q68DU8 428 aa18.23■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 HSPH1Q92598 858 aa18.23■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 HINFPQ9BQA5 517 aa18.23■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 PFASO15067 1338 aa18.23■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 RASGRF2O14827 1237 aa18.23■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 SLC15A2Q16348 729 aa18.23■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 SLC10A5Q5PT55 438 aa18.23■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 PYROXD1Q8WU10 500 aa18.23■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 TRIM9Q9C026 710 aa18.23■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa18.23■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 SDC4P31431 198 aa18.23■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 SMYD2Q9NRG4 433 aa18.23■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 STX1BP61266 288 aa18.23■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 CAV1Q03135 178 aa18.23■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP18.23■□□□□ 0.515e-10■■■□□ 17.7
NISCH-213ENST00000489895 BBS9Q3SYG4 887 aa18.23■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 LRRC31Q6UY01 552 aa18.23■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa18.23■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa18.22■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 TMED2Q15363 201 aa18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms