RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489537.5

SF3A3-208, Transcript of splicing factor 3a subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene SF3A3, Length 891 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3-208ENST00000489537 SAMM50Q9Y512 469 aa7□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa7□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 DOCK1Q14185 1865 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 A0A087WWV3 80 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 E9PMD0 336 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 MAPK13O15264 365 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 KIF5CO60282 957 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 SLITRK3O94933 977 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 HOXC6P09630 235 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 CASP1P29466 404 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 ICAM3P32942 547 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 KRT9P35527 623 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 RGS19P49795 217 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 ETF1P62495 437 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 ADAM9Q13443 819 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 NEDD9Q14511 834 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 PPP2R5AQ15172 486 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 SPA17Q15506 151 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 RINT1Q6NUQ1 792 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 C1orf186Q6ZWK4 172 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 VPS36Q86VN1 386 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 SLC9A9Q8IVB4 645 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 FAM178BQ8IXR5 827 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 ANKRD35Q8N283 1001 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 MYCT1Q8N699 235 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 TC2NQ8N9U0 490 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 KIAA0895Q8NCT3 520 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 MYRIPQ8NFW9 859 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 NEK11Q8NG66 645 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 FAM174AQ8TBP5 190 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 ATG4CQ96DT6 458 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 FAM81BQ96LP2 452 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 DNAJC7Q99615 494 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 PTPN18Q99952 460 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 LXNQ9BS40 222 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 VPS16Q9H269 839 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 ZHX3Q9H4I2 956 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 HAUS4Q9H6D7 363 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 TAB2Q9NYJ8 693 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 FBXL5Q9UKA1 691 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 PYCARDQ9ULZ3 195 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 KCNH4Q9UQ05 1017 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 OTOFQ9HC10 1997 aa6.99□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 NFIBO00712 420 aa6.98□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 P4HA2O15460 535 aa6.98□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 KRT86O43790 486 aa6.98□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 USO1O60763 962 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 GCNT3O95395 438 aa6.98□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 TUBBP07437 444 aa6.98□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 FCER1AP12319 257 aa6.98□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 ITGB5P18084 799 aa6.98□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 CASP14P31944 242 aa6.98□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 TM4SF4P48230 202 aa6.98□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 SOX10P56693 466 aa6.98□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 SNAP25P60880 206 aa6.98□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 RBL2Q08999 1139 aa6.98□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 LRMPQ12912 555 aa6.98□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 SNAPC2Q13487 334 aa6.98□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 IRF5Q13568 498 aa6.98□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 VGLL4Q14135 290 aa6.98□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 AGERQ15109 404 aa6.98□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 ZCWPW2Q504Y3 356 aa6.98□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa6.98□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 ODR4Q5SWX8 454 aa6.98□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 C10orf76Q5T2E6 689 aa6.98□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 FAM160B1Q5W0V3 765 aa6.98□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa6.98□□□□□ -1.29
SF3A3-208ENST00000489537 IRF2BP1Q8IU81 584 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms