RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489442.5

CCL28-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 28, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL28, Length 1,342 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28-202ENST00000489442 CATSPER4Q7RTX7 472 aa14.89□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 SPRED2Q7Z698 418 aa14.89□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 MICALL1Q8N3F8 863 aa14.89□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 IGSF22Q8N9C0 903 aa14.89□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 RNF149Q8NC42 400 aa14.89□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 FBXO22Q8NEZ5 403 aa14.89□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 SAMD11Q96NU1 681 aa14.89□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 C17orf80Q9BSJ5 609 aa14.89□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 DACT1Q9NYF0 836 aa14.89□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 KIAA1024Q9UPX6 916 aa14.89□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa14.88□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 VWA3AA6NCI4 1184 aa14.88□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 C9IYK1 514 aa14.88□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 BMP15O95972 392 aa14.88□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 PHKA2P46019 1235 aa14.88□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 MAEAQ7L5Y9 396 aa14.88□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa14.88□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 RNF169Q8NCN4 708 aa14.88□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 MCPH1Q8NEM0 835 aa14.88□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa14.88□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 CHST12Q9NRB3 414 aa14.88□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa14.87□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 A0A0C4DFX4 3053 aa14.87□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 EPOPA6NHQ4 379 aa14.87□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 CDC25AP30304 524 aa14.87□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 CTNNB1P35222 781 aa14.87□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 DSC3Q14574 896 aa14.87□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 EPC2Q52LR7 807 aa14.87□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 PADI6Q6TGC4 694 aa14.87□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 TMEM192Q8IY95 271 aa14.87□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 SLC17A8Q8NDX2 589 aa14.87□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 GDPD5Q8WTR4 605 aa14.87□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 IFT122Q9HBG6 1241 aa14.87□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 TMEM161AQ9NX61 479 aa14.87□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 DNM3Q9UQ16 869 aa14.87□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 RWDD3Q9Y3V2 267 aa14.87□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 TBKBP1A7MCY6 615 aa14.86□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 PP2D1A8MPX8 630 aa14.86□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 STX6O43752 255 aa14.86□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 ERLIN2O94905 339 aa14.86□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 FAM189BP81408 668 aa14.86□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 GRB10Q13322 594 aa14.86□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 IL17AQ16552 155 aa14.86□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 FAM102BQ5T8I3 360 aa14.86□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 ABI1Q8IZP0 508 aa14.86□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 CRIPAKQ8N1N5 446 aa14.86□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa14.86□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 BHMT2Q9H2M3 363 aa14.86□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 MYO7AQ13402 2215 aa14.86□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa14.85□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 HOXA2O43364 376 aa14.85□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 SKIP12755 728 aa14.85□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 ARL2P36404 184 aa14.85□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 GPM6BQ13491 265 aa14.85□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 ECM1Q16610 540 aa14.85□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 ECHDC2Q86YB7 292 aa14.85□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 ASAP3Q8TDY4 903 aa14.85□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 NT5C3AQ9H0P0 336 aa14.85□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 MTCH2Q9Y6C9 303 aa14.85□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 COL4A6Q14031 1691 aa14.84□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 A0A0U1RQF3 1178 aa14.84□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 LRRIQ4A6NIV6 560 aa14.84□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 EOMESO95936 686 aa14.84□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 RB1P06400 928 aa14.84□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 FGFR1P11362 822 aa14.84□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 CYP11B2P19099 503 aa14.84□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 GLRA2P23416 452 aa14.84□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 BMPR1AP36894 532 aa14.84□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 GATMP50440 423 aa14.84□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 PTENP60484 403 aa14.84□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 POU5F1BQ06416 359 aa14.84□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 CAPSQ13938 189 aa14.84□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 PTPROQ16827 1216 aa14.84□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa14.84□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 RASSF8Q8NHQ8 419 aa14.84□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 AK8Q96MA6 479 aa14.84□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 MINDY3Q9H8M7 445 aa14.84□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 GPRC5CQ9NQ84 441 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms