RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484474.1

ERBB4-208, Transcript of erb-b2 receptor tyrosine kinase 4, human

TSL 3

Gene ERBB4, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERBB4-208	ENST00000484474	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	CPXCR1	Q8N123	301 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	DNER	Q8NFT8	737 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	OPTN	Q96CV9	577 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	GSDMA	Q96QA5	445 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	RIT2	Q99578	217 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	MROH8	Q9H579	483 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	ACAD9	Q9H845	621 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	ZNF536	O15090	1300 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	DOCK1	Q14185	1865 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	SMTNL1	A8MU46	457 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	LINC01387	J3KSC0	135 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	MEIS1	O00470	390 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	STRN	O43815	780 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	EPHA1	P21709	976 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	SCNN1A	P37088	669 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	STAT6	P42226	847 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	TEC	P42680	631 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	TXK	P42681	527 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	CAMK4	Q16566	473 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	STX1A	Q16623	288 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	UBE2S	Q16763	222 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	LONRF3	Q496Y0	759 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	CEP135	Q66GS9	1140 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	NLRX1	Q86UT6	975 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	ATCAY	Q86WG3	371 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	MLKL	Q8NB16	471 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	REPS2	Q8NFH8	660 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	NEK9	Q8TD19	979 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	ATG4C	Q96DT6	458 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	CLIC6	Q96NY7	704 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	RMDN3	Q96TC7	470 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	DISC1	Q9NRI5	854 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	RNF146	Q9NTX7	359 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	TMEM260	Q9NX78	707 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	CNTN3	Q9P232	1028 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	TCHH	Q07283	1943 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
ERBB4-208	ENST00000484474	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ERBB4-208	ENST00000484474	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ERBB4-208	ENST00000484474	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ERBB4-208	ENST00000484474	BECN2	A8MW95	431 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ERBB4-208	ENST00000484474	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ERBB4-208	ENST00000484474	FSCN2	O14926	492 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ERBB4-208	ENST00000484474	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ERBB4-208	ENST00000484474	TGFB3	P10600	412 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ERBB4-208	ENST00000484474	NPR3	P17342	541 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ERBB4-208	ENST00000484474	CCND2	P30279	289 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ERBB4-208	ENST00000484474	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ERBB4-208	ENST00000484474	SFN	P31947	248 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ERBB4-208	ENST00000484474	NLRP12	P59046	1061 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ERBB4-208	ENST00000484474	SNAP25	P60880	206 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ERBB4-208	ENST00000484474	HERVK_113	P62684	666 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ERBB4-208	ENST00000484474	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ERBB4-208	ENST00000484474	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41

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