RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483873.6

GTF3C4-202, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GTF3C4, Length 1,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4-202ENST00000483873 DSC3Q14574 896 aa29.44■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 SPECC1Q5M775 1068 aa29.44■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 PPP2R2DQ66LE6 453 aa29.44■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 RNF149Q8NC42 400 aa29.44■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 CLIC6Q96NY7 704 aa29.44■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 RAD9AQ99638 391 aa29.44■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 CSRNP2Q9H175 543 aa29.44■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC28A3Q9HAS3 691 aa29.44■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 MTMR10Q9NXD2 777 aa29.44■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 COL4A6Q14031 1691 aa29.44■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 ASAP2O43150 1006 aa29.43■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 CYP11B2P19099 503 aa29.43■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 CAPSQ13938 189 aa29.43■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC39A14Q15043 492 aa29.43■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 TMEM119Q4V9L6 283 aa29.43■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 MCPH1Q8NEM0 835 aa29.43■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 MINDY3Q9H8M7 445 aa29.43■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 POLD4Q9HCU8 107 aa29.43■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 DENND3A2RUS2 1198 aa29.42■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 UBA7P41226 1012 aa29.42■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 FAM102BQ5T8I3 360 aa29.42■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 USP49Q70CQ1 688 aa29.42■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 SPRED2Q7Z698 418 aa29.42■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 LRRC15Q8TF66 581 aa29.42■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa29.42■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 RGS18Q9NS28 235 aa29.42■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 ZDHHC9Q9Y397 364 aa29.42■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 GUCD1Q96NT3 240 aa29.41■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 NT5C3AQ9H0P0 336 aa29.41■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 MYO9BQ13459 2157 aa29.41■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 NLRC5Q86WI3 1866 aa29.41■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP29.4■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 TAP1Q03518 808 aa29.4■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 GRIN2CQ14957 1233 aa29.4■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 KARSQ15046 597 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 STK38Q15208 465 aa29.4■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 CRIPAKQ8N1N5 446 aa29.4■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 LINC00301Q8NCQ3 95 aa29.4■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 EPSTI1Q96J88 318 aa29.4■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 INSL6Q9Y581 213 aa29.4■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 MYH11P35749 1972 aa29.39■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 C9IYK1 514 aa29.39■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 BRD1O95696 1058 aa29.39■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 PHKA2P46019 1235 aa29.39■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 SARSP49591 514 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 PTENP60484 403 aa29.39■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 CATSPER4Q7RTX7 472 aa29.39■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa29.39■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 BSNDQ8WZ55 320 aa29.39■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 YME1L1Q96TA2 773 aa29.39■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 RUSC1Q9BVN2 902 aa29.39■■■□□ 2.3
GTF3C4-202ENST00000483873 TFDP1Q14186 410 aa29.38■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 NPAS4Q8IUM7 802 aa29.38■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 CALML4Q96GE6 196 aa29.38■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 CERS4Q9HA82 394 aa29.38■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 C1orf112Q9NSG2 853 aa29.38■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 LINC01553A4QN01 128 aa29.37■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP29.37■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 PLCG1P19174 1290 aa29.37■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 RINT1Q6NUQ1 792 aa29.37■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC24A5Q71RS6 500 aa29.37■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 CCSER1Q9C0I3 900 aa29.37■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 KIAA1671Q9BY89 1806 aa29.37■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC26A4O43511 780 aa29.37■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 COL6A3P12111 3177 aa29.36■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 TCHHQ07283 1943 aa29.36■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 LRRIQ4A6NIV6 560 aa29.36■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 SPTLC2O15270 562 aa29.36■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 YEATS4O95619 227 aa29.36■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 PLA2G4BP0C869 781 aa29.36■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 GATMP50440 423 aa29.36■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC12A3P55017 1021 aa29.36■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 POU5F1BQ06416 359 aa29.36■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 C1orf186Q6ZWK4 172 aa29.36■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 RASSF8Q8NHQ8 419 aa29.36■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 PRDM12Q9H4Q4 367 aa29.36■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa29.36■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa29.35■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 DGKIO75912 1065 aa29.35■■■□□ 2.29
GTF3C4-202ENST00000483873 STAG3L1P0CL83 205 aa29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms