RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481220.5

SNHG12-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, humanhuman

TSL 3

Gene SNHG12, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12-208ENST00000481220 TCEAL5Q5H9L2 206 aa20.34■□□□□ 0.85
SNHG12-208ENST00000481220 FAM184AQ8NB25 1140 aa20.34■□□□□ 0.85
SNHG12-208ENST00000481220 KLHL23Q8NBE8 558 aa20.34■□□□□ 0.85
SNHG12-208ENST00000481220 SPPL3Q8TCT6 385 aa20.34■□□□□ 0.85
SNHG12-208ENST00000481220 NEK9Q8TD19 979 aa20.34■□□□□ 0.85
SNHG12-208ENST00000481220 TMEM143Q96AN5 459 aa20.34■□□□□ 0.85
SNHG12-208ENST00000481220 TBC1D32Q96NH3 1257 aa20.34■□□□□ 0.85
SNHG12-208ENST00000481220 CASD1Q96PB1 797 aa20.34■□□□□ 0.85
SNHG12-208ENST00000481220 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SNHG12-208ENST00000481220 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
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SNHG12-208ENST00000481220 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa20.34■□□□□ 0.85
SNHG12-208ENST00000481220 POTEMA6NI47 508 aa20.33■□□□□ 0.85
SNHG12-208ENST00000481220 ST18O60284 1047 aa20.33■□□□□ 0.85
SNHG12-208ENST00000481220 EMC2Q15006 297 aa20.33■□□□□ 0.85
SNHG12-208ENST00000481220 XKR9Q5GH70 373 aa20.33■□□□□ 0.85
SNHG12-208ENST00000481220 LRRC55Q6ZSA7 311 aa20.33■□□□□ 0.85
SNHG12-208ENST00000481220 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.33■□□□□ 0.85
SNHG12-208ENST00000481220 TMX3Q96JJ7 454 aa20.33■□□□□ 0.85
SNHG12-208ENST00000481220 NLRP4Q96MN2 994 aa20.33■□□□□ 0.85
SNHG12-208ENST00000481220 TMEM117Q9H0C3 514 aa20.33■□□□□ 0.85
SNHG12-208ENST00000481220 CWH43Q9H720 699 aa20.33■□□□□ 0.85
SNHG12-208ENST00000481220 ANKEF1Q9NU02 776 aa20.33■□□□□ 0.85
SNHG12-208ENST00000481220 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SNHG12-208ENST00000481220 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa20.33■□□□□ 0.84
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SNHG12-208ENST00000481220 EOMESO95936 686 aa20.32■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 TRAPPC10P48553 1259 aa20.32■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.32■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 ZNF174Q15697 407 aa20.32■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 CLLU1OSQ5K130 101 aa20.32■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 FERMT3Q86UX7 667 aa20.32■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 MINDY3Q9H8M7 445 aa20.32■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 DACT1Q9NYF0 836 aa20.32■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 MYO7AQ13402 2215 aa20.32■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 RARRES1P49788 294 aa20.31■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 TTC38Q5R3I4 469 aa20.31■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 CATSPER3Q86XQ3 398 aa20.31■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 ARID2Q68CP9 1835 aa20.31■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 NCOR1O75376 2440 aa20.3■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 A0A087WWV3 80 aa20.3■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 HOXA2O43364 376 aa20.3■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 OR52Z1P0C646 297 aa20.3■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa20.3■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 TECP42680 631 aa20.3■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 PHKA2P46019 1235 aa20.3■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 NBR1Q14596 966 aa20.3■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 CTC1Q2NKJ3 1217 aa20.3■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 LEXMQ3ZCV2 418 aa20.3■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa20.3■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 PIGOQ8TEQ8 1089 aa20.3■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 TCP11Q8WWU5 503 aa20.3■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 TUFT1Q9NNX1 390 aa20.3■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 TNFRSF10AO00220 468 aa20.29■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 ASAP2O43150 1006 aa20.29■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 MED24O75448 989 aa20.29■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 DGAT1O75907 488 aa20.29■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 KCNA5P22460 613 aa20.29■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 IRS1P35568 1242 aa20.29■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 ARL2P36404 184 aa20.29■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 HYAL1Q12794 435 aa20.29■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa20.29■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 POF1BQ8WVV4 589 aa20.29■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 MTRQ99707 1265 aa20.29■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 AAASQ9NRG9 546 aa20.29■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa20.29■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa20.29■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 ZNF623O75123 536 aa20.28■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 FGF18O76093 207 aa20.28■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 LTBRP36941 435 aa20.28■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 POU5F1BQ06416 359 aa20.28■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 CATSPER4Q7RTX7 472 aa20.28■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 RNF149Q8NC42 400 aa20.28■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 LAG3P18627 525 aa20.27■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 RPA1P27694 616 aa20.27■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 PTENP60484 403 aa20.27■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 UBE3AQ05086 875 aa20.27■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SNHG12-208ENST00000481220 LRRC43Q8N309 656 aa20.27■□□□□ 0.84
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