RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481081.1

CASQ1-203, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CASQ1, Length 869 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-203ENST00000481081 MAFGO15525 162 aa8.25□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 PROS1P07225 676 aa8.25□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 GALTP07902 379 aa8.25□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 CNPP09543 421 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 LAMP2P13473 410 aa8.25□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 MX1P20591 662 aa8.25□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 ACTR2P61160 394 aa8.25□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 GPC5P78333 572 aa8.25□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 DMWDQ09019 674 aa8.25□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 SPEM2Q0P670 501 aa8.25□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 MTMR1Q13613 665 aa8.25□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 HTR4Q13639 388 aa8.25□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 GRM4Q14833 912 aa8.25□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 CYP26C1Q6V0L0 522 aa8.25□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM87AQ8NBN3 555 aa8.25□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 PPP1R16BQ96T49 567 aa8.25□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 BCO2Q9BYV7 579 aa8.25□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 OSBPL6Q9BZF3 934 aa8.25□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 JADE2Q9NQC1 790 aa8.25□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 PKD2L1Q9P0L9 805 aa8.25□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 SLC9A2Q9UBY0 812 aa8.25□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 LOC400499M0QZD8 3231 aa8.25□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 LAMA1P25391 3075 aa8.24□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 F5P12259 2224 aa8.24□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa8.24□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 HBP1O60381 514 aa8.24□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 VTNP04004 478 aa8.24□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 TDGF1P13385 188 aa8.24□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 ATP4AP20648 1035 aa8.24□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 KLRC2P26717 231 aa8.24□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 SLC26A2P50443 739 aa8.24□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 FZD5Q13467 585 aa8.24□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 TSSK4Q6SA08 328 aa8.24□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 TICAM2Q86XR7 235 aa8.24□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa8.24□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 STAMQ92783 540 aa8.24□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 CLDN23Q96B33 292 aa8.24□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 SHDQ96IW2 340 aa8.24□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 ADAMTS10Q9H324 1103 aa8.24□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa8.24□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 GMEB2Q9UKD1 530 aa8.24□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 NUMBLQ9Y6R0 609 aa8.24□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 MYH15Q9Y2K3 1946 aa8.24□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 COL1A2P08123 1366 aa8.23□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 FAM170BA6NMN3 283 aa8.23□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 TM4SF5O14894 197 aa8.23□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 INPPL1O15357 1258 aa8.23□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 GDF9O60383 454 aa8.23□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 B4GALT3O60512 393 aa8.23□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 LRP3O75074 770 aa8.23□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP8.23□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 RFPL2O75678 378 aa8.23□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 C22orf31O95567 290 aa8.23□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 MAGEA9P43362 315 aa8.23□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 PRKCQQ04759 706 aa8.23□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF484Q5JVG2 852 aa8.23□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 CYB5R4Q7L1T6 521 aa8.23□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 LINC01465Q8N7H1 131 aa8.23□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 RNF169Q8NCN4 708 aa8.23□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 FGF14Q92915 247 aa8.23□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa8.23□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 LTB4R2Q9NPC1 389 aa8.23□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 MAN1C1Q9NR34 630 aa8.23□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 KCNH7Q9NS40 1196 aa8.23□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP8.23□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 NFASCO94856 1347 aa8.23□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 AKAP13Q12802 2813 aa8.22□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa8.22□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 CARNS1A5YM72 827 aa8.22□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 SHISA7A6NL88 538 aa8.22□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 SPDYE4A6NLX3 237 aa8.22□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 RETP07949 1114 aa8.22□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 RPS9P46781 194 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 SLC11A1P49279 550 aa8.22□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 TROAPQ12815 778 aa8.22□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 UBXN2BQ14CS0 331 aa8.22□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 SLC44A4Q53GD3 710 aa8.22□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 LAIR1Q6GTX8 287 aa8.22□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 ABHD15Q6UXT9 468 aa8.22□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 PRR23CQ6ZRP0 262 aa8.22□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms