RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		12.38	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959		E9PMD0	336 aa		12.38	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	LAD1	O00515	517 aa		12.38	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	DGAT1	O75907	488 aa		12.38	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	IGFBP4	P22692	258 aa		12.38	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	GLRA2	P23416	452 aa		12.38	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	DNM2	P50570	870 aa		12.38	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		12.38	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	BRAP	Q7Z569	592 aa		12.38	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	HSCB	Q8IWL3	235 aa		12.38	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		12.38	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	RNF149	Q8NC42	400 aa		12.38	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	12.38	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	PNMA5	Q96PV4	448 aa		12.38	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	12.38	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	12.38	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	POLD4	Q9HCU8	107 aa		12.38	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	12.38	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	12.38	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	12.38	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		12.37	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	EDN1	P05305	212 aa		12.37	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		12.37	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	ARL2	P36404	184 aa		12.37	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	PKP1	Q13835	747 aa		12.37	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	PTPA	Q15257	358 aa		12.37	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	EPC2	Q52LR7	807 aa		12.37	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		12.37	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	FIBCD1	Q8N539	461 aa		12.37	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		12.37	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	PPM1E	Q8WY54	764 aa		12.37	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	PLIN2	Q99541	437 aa		12.37	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		12.37	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		12.37	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		12.37	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		12.37	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	CLIC4	Q9Y696	253 aa		12.37	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		12.37	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	STX6	O43752	255 aa		12.36	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	PDC	P20941	246 aa		12.36	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	12.36	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	CTNNB1	P35222	781 aa		12.36	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		12.36	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	PDIA5	Q14554	519 aa		12.36	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	AMHR2	Q16671	573 aa		12.36	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	LONRF3	Q496Y0	759 aa		12.36	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		12.36	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	PADI6	Q6TGC4	694 aa		12.36	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		12.36	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		12.36	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		12.36	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM192	Q8IY95	271 aa		12.36	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		12.36	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	TCP11	Q8WWU5	503 aa		12.36	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	LPP	Q93052	612 aa		12.36	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	NACC1	Q96RE7	527 aa		12.36	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		12.36	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		12.36	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		12.36	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		12.36	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		12.36	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		12.35	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		12.35	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		12.35	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	B4GALT5	O43286	388 aa		12.35	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	TSPAN1	O60635	241 aa		12.35	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	CSPG5	O95196	566 aa		12.35	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	STAG3L1	P0CL83	205 aa		12.35	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	PTEN	P60484	403 aa		12.35	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM189B	P81408	668 aa		12.35	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		12.35	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	ODR4	Q5SWX8	454 aa		12.35	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	UBXN11	Q5T124	520 aa		12.35	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	RNF169	Q8NCN4	708 aa		12.35	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	CPB2	Q96IY4	423 aa		12.35	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	USP28	Q96RU2	1077 aa		12.35	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRIP11	Q15643	1979 aa		12.34	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		12.34	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	12.34	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	CYP11B2	P19099	503 aa		12.34	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	MUT	P22033	750 aa		12.34	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	PBX3	P40426	434 aa		12.34	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	PHKA2	P46019	1235 aa		12.34	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAPK7	Q13164	816 aa		12.34	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	HYI	Q5T013	277 aa		12.34	□□□□□ -0.43

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