RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471650.5

SH3BP1-207, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 900 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-207ENST00000471650 ZBED2Q9BTP6 218 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 CCSER1Q9C0I3 900 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 ERAP1Q9NZ08 941 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 A0A1W2PQ27 194 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 A0A1W2PQ64 194 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 A0A1W2PQD8 194 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 H3BRB1 525 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 HAS3O00219 553 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 LINC01565O15544 149 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF862O60290 1169 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 STBD1O95210 358 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 F2P00734 622 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 CMA1P23946 247 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 KCNJ6P48051 423 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 PSEN2P49810 448 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 CYP4A11Q02928 519 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 MFSD10Q14728 455 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 PLCB4Q15147 1175 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 ECM1Q16610 540 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 TIGD5Q53EQ6 642 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 HYIQ5T013 277 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 RESP18Q5W5W9 173 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 CABP7Q86V35 215 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 C4orf19Q8IY42 314 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 PNMA5Q96PV4 448 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 CTAGE1Q96RT6 745 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 KATNAL1Q9BW62 490 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 FAM50BQ9Y247 325 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 KAT6AQ92794 2004 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 USP24Q9UPU5 2620 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 PITPNM1O00562 1244 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 PRKCEQ02156 737 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 SIGLEC14Q08ET2 396 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 HYAL1Q12794 435 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 KIAA0753Q2KHM9 967 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 XKR3Q5GH77 459 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 KCTD17Q8N5Z5 321 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 ATP8B4Q8TF62 1192 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 CALML4Q96GE6 196 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 FAM167AQ96KS9 214 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 NACC1Q96RE7 527 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 RNPEPQ9H4A4 650 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 NRBP2Q9NSY0 501 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 FAM13BQ9NYF5 915 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 CCDC39Q9UFE4 941 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 KIAA1024Q9UPX6 916 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 DDX11L8A8MPP1 907 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 LOC730098B7Z3J9 87 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 OATP04181 439 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 MARK3P27448 753 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 YWHABP31946 246 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 TXLNAP40222 546 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 KARSQ15046 597 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 NBPF20Q3BBV1 942 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 TMEM119Q4V9L6 283 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 EPC2Q52LR7 807 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 POTEGQ6S5H5 508 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 CKAP2LQ8IYA6 745 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 TMEM105Q8N8V8 129 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 NT5C3AQ9H0P0 336 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 HPSEQ9Y251 543 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 MICAL3Q7RTP6 2002 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 A0A087WWV3 80 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 A0A087X0B3 334 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 ZBTB39O15060 712 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 HBP1O60381 514 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 NBNO60934 754 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 PLCG1P19174 1290 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF484Q5JVG2 852 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 RRAGBQ5VZM2 374 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 NFRKBQ6P4R8 1299 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-207ENST00000471650 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms