RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 TBC1D22BQ9NU19 505 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 TBC1D7Q9P0N9 293 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 TMEM59LQ9UK28 342 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 PFASO15067 1338 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 ZNF536O15090 1300 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 SIPA1L1O43166 1804 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 ARHGEF35A5YM69 484 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 GOLGA6CA6NDK9 693 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 MAFGO15525 162 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 AKAP3O75969 853 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 KIF4AO95239 1232 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 EGFRP00533 1210 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 GOLGA6DP0CG33 693 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 KLRC1P26715 233 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 SOX5P35711 763 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 STAT3P40763 770 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 HSD17B4P51659 736 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 SKOR1P84550 965 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 PTK2Q05397 1052 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 C2orf54Q08AI8 447 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 NBPF9Q3BBW0 867 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 USH1GQ495M9 461 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 TCERG1LQ5VWI1 586 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 NFRKBQ6P4R8 1299 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 B3GNT9Q6UX72 402 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.935e-17■□□□□ 10
ACTB-208ENST00000464611 TPH2Q8IWU9 490 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 RHOT2Q8IXI1 618 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 RASGEF1CQ8N431 466 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 GLIS3Q8NEA6 775 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 SCFD2Q8WU76 684 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 HOOK2Q96ED9 719 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 RUNDC3BQ96NL0 473 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 MXRA8Q9BRK3 442 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 ZNF577Q9BSK1 485 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 FAM129AQ9BZQ8 928 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 ISCUQ9H1K1 167 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 AMFRQ9UKV5 643 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 NENFQ9UMX5 172 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 EXOC7Q9UPT5 735 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 ASTN1O14525 1302 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 ERICH4A6NGS2 130 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 GOLGA6L10A6NI86 522 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 H0YCG3 227 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 TULP2O00295 520 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 OPLAHO14841 1288 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 TGFB1I1O43294 461 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 BUB1O43683 1085 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 CFBP00751 764 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 ICAM1P05362 532 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 MYBP10242 640 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 SLC9A1P19634 815 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 SFNP31947 248 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 HOXD13P35453 343 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 GGCXP38435 758 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 NOP2P46087 812 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 FMO5P49326 533 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 CDR1P51861 262 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 PSMC6P62333 389 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 RUFY4Q6ZNE9 571 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 PEX26Q7Z412 305 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 IQCKQ8N0W5 287 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 LRRC57Q8N9N7 239 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 TPCN2Q8NHX9 752 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 SLC30A5Q8TAD4 765 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 RFFLQ8WZ73 363 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 DRC1Q96MC2 740 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 ACCSQ96QU6 501 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 STRA6Q9BX79 667 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 C17orf75Q9HAS0 396 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 FAM114A2Q9NRY5 505 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 ANKEF1Q9NU02 776 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 GCNT4Q9P109 453 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 TFR2Q9UP52 801 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 MYH10P35580 1976 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 A0A1W2PRG0 241 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 ANKRD62A6NC57 917 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 TCP10L2B9ZVM9 353 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 WDR46O15213 610 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 ZEB2O60315 1214 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 GDF11O95390 407 aa9.24□□□□□ -0.93
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