RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC15Q8TF66 581 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 ARNTL2Q8WYA1 636 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 APBB2Q92870 758 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 ADAM2Q99965 735 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 ZBED2Q9BTP6 218 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 MINDY3Q9H8M7 445 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 IFT122Q9HBG6 1241 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
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RABGEF1-206ENST00000461017 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 M0QZ92 97 aa7.83□□□□□ -1.16
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RABGEF1-206ENST00000461017 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
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RABGEF1-206ENST00000461017 TRAPPC10P48553 1259 aa7.83□□□□□ -1.16
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RABGEF1-206ENST00000461017 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
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RABGEF1-206ENST00000461017 MAEAQ7L5Y9 396 aa7.83□□□□□ -1.16
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RABGEF1-206ENST00000461017 IGSF22Q8N9C0 903 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 IL27Q8NEV9 243 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 ASAP3Q8TDY4 903 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 GDPD5Q8WTR4 605 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
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RABGEF1-206ENST00000461017 SNX21Q969T3 373 aa7.83□□□□□ -1.16
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RABGEF1-206ENST00000461017 RGS18Q9NS28 235 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKEF1Q9NU02 776 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 MTUS1Q9ULD2 1270 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 INSL6Q9Y581 213 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 MTCH2Q9Y6C9 303 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 C5orf42Q9H799 3197 aa7.83□□□□□ -1.16
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RABGEF1-206ENST00000461017 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa7.82□□□□□ -1.16
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RABGEF1-206ENST00000461017 SYT1P21579 422 aa7.82□□□□□ -1.16
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RABGEF1-206ENST00000461017 ARL2P36404 184 aa7.82□□□□□ -1.16
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RABGEF1-206ENST00000461017 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
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RABGEF1-206ENST00000461017 NLRP4Q96MN2 994 aa7.82□□□□□ -1.16
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RABGEF1-206ENST00000461017 MAP7D2Q96T17 732 aa7.82□□□□□ -1.16
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RABGEF1-206ENST00000461017 CLIC4Q9Y696 253 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
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RABGEF1-206ENST00000461017 EPC2Q52LR7 807 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 UBXN11Q5T124 520 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 OTUD6AQ7L8S5 288 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 ECHDC2Q86YB7 292 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 NPAS4Q8IUM7 802 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM192Q8IY95 271 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 NEK9Q8TD19 979 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 LPPQ93052 612 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 CASD1Q96PB1 797 aa7.81□□□□□ -1.16
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