RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.441e-7■□□□□ 9.4
RABGGTB-203ENST00000459697 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 CCDC152Q4G0S7 254 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 WDR78Q5VTH9 848 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 COPS6Q7L5N1 327 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 RNF180Q86T96 592 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 RPAINQ86UA6 219 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 SCYL3Q8IZE3 742 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 NUP133Q8WUM0 1156 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 RNF32Q9H0A6 362 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 MFSD1Q9H3U5 465 aa6.05□□□□□ -1.44
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RABGGTB-203ENST00000459697 TJP2Q9UDY2 1190 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 MINPP1Q9UNW1 487 aa6.05□□□□□ -1.44
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RABGGTB-203ENST00000459697 LOC730098B7Z3J9 87 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 GFRA2O00451 464 aa6.04□□□□□ -1.44
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RABGGTB-203ENST00000459697 LTBRP36941 435 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 CRKP46108 304 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 PTPN21Q16825 1174 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 TCEAL5Q5H9L2 206 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa6.04□□□□□ -1.44
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RABGGTB-203ENST00000459697 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM83AQ86UY5 434 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 HERC6Q8IVU3 1022 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 ZFPM1Q8IX07 1006 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC9A7Q96T83 725 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 PAGR1Q9BTK6 254 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 HIPK3Q9H422 1215 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 MIS18AQ9NYP9 233 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 USP18Q9UMW8 372 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 PTPN13Q12923 2485 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 A0A1B0GUL7 405 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 TLR3O15455 904 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 RARBP10826 455 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 KCNJ4P48050 445 aa6.03□□□□□ -1.44
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RABGGTB-203ENST00000459697 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 SEPT6Q14141 434 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
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RABGGTB-203ENST00000459697 OXR1Q8N573 874 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 PDZD8Q8NEN9 1154 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM87BQ96K49 555 aa6.03□□□□□ -1.44
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RABGGTB-203ENST00000459697 Q96M66 194 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 DUSP13Q9UII6 198 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 A0A1B0GUL6 1792 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 MYO18BQ8IUG5 2567 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-203ENST00000459697 COL12A1Q99715 3063 aa6.02□□□□□ -1.44
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RABGGTB-203ENST00000459697 ICAM3P32942 547 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-203ENST00000459697 CLCN5P51795 746 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-203ENST00000459697 ACLYP53396 1101 aa6.02□□□□□ -1.45
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RABGGTB-203ENST00000459697 PTPROQ16827 1216 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-203ENST00000459697 GAB4Q2WGN9 574 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-203ENST00000459697 MFSD14BQ5SR56 506 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-203ENST00000459697 MCM10Q7L590 875 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-203ENST00000459697 DEFB128Q7Z7B8 93 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-203ENST00000459697 SCLYQ96I15 445 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-203ENST00000459697 FRMD6Q96NE9 622 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-203ENST00000459697 ASB16Q96NS5 453 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-203ENST00000459697 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC6A17Q9H1V8 727 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-203ENST00000459697 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-203ENST00000459697 CTNNA3Q9UI47 895 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-203ENST00000459697 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-203ENST00000459697 KALRNO60229 2985 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-203ENST00000459697 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.02□□□□□ -1.45
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