RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 LRRC43Q8N309 656 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 RDM1Q8NG50 284 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 LPPQ93052 612 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 TM6SF1Q9BZW5 370 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 HIDE1A8MVS5 230 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC37A4O43826 429 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 CXCL14O95715 111 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 EOMESO95936 686 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 CYP3A7P24462 503 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 PPM1AP35813 382 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 QARSP47897 775 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 NPEPPSP55786 919 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 SCRN1Q12765 414 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 COASYQ13057 564 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 DUSP6Q16828 381 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 CLLU1OSQ5K130 101 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 NCAPH2Q6IBW4 605 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 NEK8Q86SG6 692 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC01465Q8N7H1 131 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 MSLNLQ96KJ4 702 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 CEP170P1Q96L14 293 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 GJB4Q9NTQ9 266 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A0U1RQF3 1178 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 EML1O00423 815 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 MAFO75444 373 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 EYA4O95677 639 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 GLP2RO95838 553 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 BCAR1P56945 870 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 PLCB3Q01970 1234 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 XKR9Q5GH70 373 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 GLB1LQ6UWU2 654 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 ANO5Q75V66 913 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 OTUD6AQ7L8S5 288 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 TPH2Q8IWU9 490 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 NECAB1Q8N987 351 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 DAGLBQ8NCG7 672 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 ETNPPLQ8TBG4 499 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 OXER1Q8TDS5 423 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC7A3Q8WY07 619 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 WASF1Q92558 559 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM143Q96AN5 459 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM169Q96HH4 297 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 MFSD14AQ96MC6 490 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 PHF20Q9BVI0 1012 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 BRMS1Q9HCU9 246 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 CYP26B1Q9NR63 512 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 CHST12Q9NRB3 414 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 RNF19AQ9NV58 838 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 LZTS1Q9Y250 596 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 FSD2A1L4K1 749 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 PFKFB2O60825 505 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 P4HBP07237 508 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 SKIP12755 728 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 ATP2B1P20020 1258 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 KRT2P35908 639 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 PHKA2P46019 1235 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 CYP4A11Q02928 519 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 TRIM29Q14134 588 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 ANKRD1Q15327 319 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 CES5AQ6NT32 575 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 ANKRD54Q6NXT1 300 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 MOXD1Q6UVY6 613 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 HFE2Q6ZVN8 426 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF410Q86VK4 478 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 POTEDQ86YR6 584 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 VPS52Q8N1B4 723 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 SMRP1Q8NCR6 262 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 VN1R2Q8NFZ6 395 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 URGCPQ8TCY9 931 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 AUTS2Q8WXX7 1259 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 EDAQ92838 391 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 PBXIP1Q96AQ6 731 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 PGBD4Q96DM1 585 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms