RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C1orf112Q9NSG2 853 aa12.49□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KIAA1024Q9UPX6 916 aa12.49□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CLIC4Q9Y696 253 aa12.49□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 REV3LO60673 3130 aa12.49□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A0A087WWV3 80 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A0A0U1RQF3 1178 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 VWA3AA6NCI4 1184 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TLL1O43897 1013 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF623O75123 536 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ARHGEF15O94989 841 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GLRA2P23416 452 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CDC25AP30304 524 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SARSP49591 514 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ERVK-21P61565 698 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GRIN2CQ14957 1233 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM119Q4V9L6 283 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ATL3Q6DD88 541 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM173BQ6P4H8 233 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PADI6Q6TGC4 694 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C1orf186Q6ZWK4 172 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 Q7L0L9 218 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KCNK18Q7Z418 384 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RHPN2Q8IUC4 686 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NPAS4Q8IUM7 802 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KSR1Q8IVT5 923 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SNX29Q8TEQ0 813 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 USP28Q96RU2 1077 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NT5C3AQ9H0P0 336 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DNM3Q9UQ16 869 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GINS2Q9Y248 185 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GBF1Q92538 1859 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LCHNA4D1U4 455 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LINC01553A4QN01 128 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BRD1O95696 1058 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EOMESO95936 686 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CA3P07451 260 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GRB10Q13322 594 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MYOCDQ8IZQ8 938 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LINC00301Q8NCQ3 95 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NLRP7Q8WX94 980 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ADAM2Q99965 735 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BHMT2Q9H2M3 363 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MINDY3Q9H8M7 445 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM161AQ9NX61 479 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ARHGEF35A5YM69 484 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 E9PMD0 336 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPP6R2O75170 966 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 F13A1P00488 732 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 STAG3L1P0CL83 205 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP12.46□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GUCY2CP25092 1073 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GRIN1Q05586 938 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CAPSQ13938 189 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AMHR2Q16671 573 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM187BQ17R55 369 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RINT1Q6NUQ1 792 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RNF149Q8NC42 400 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ASAP3Q8TDY4 903 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RSPH1Q8WYR4 309 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KIFAP3Q92845 792 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TIPINQ9BVW5 301 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FZD8Q9H461 694 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C17orf75Q9HAS0 396 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DACT1Q9NYF0 836 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KCND2Q9NZV8 630 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZDHHC9Q9Y397 364 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C5orf67F2Z3F1 127 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 YEATS4O95619 227 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DDIT3P35638 169 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UBA7P41226 1012 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PHKA2P46019 1235 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC12A3P55017 1021 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MBTD1Q05BQ5 628 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MAPK7Q13164 816 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PKP1Q13835 747 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TFDP1Q14186 410 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPP2R2DQ66LE6 453 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CABP7Q86V35 215 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DAW1Q8N136 415 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LRRC15Q8TF66 581 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SAMD11Q96NU1 681 aa12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms