RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439365.6

NPAS1-201, Transcript of neuronal PAS domain protein 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NPAS1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1-201ENST00000439365 YWHABP31946 246 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
NPAS1-201ENST00000439365 NRIP1P48552 1158 aa21.89■■□□□ 1.1
NPAS1-201ENST00000439365 COL19A1Q14993 1142 aa21.89■■□□□ 1.1
NPAS1-201ENST00000439365 CALCRLQ16602 461 aa21.89■■□□□ 1.1
NPAS1-201ENST00000439365 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa21.89■■□□□ 1.1
NPAS1-201ENST00000439365 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
NPAS1-201ENST00000439365 CATSPER4Q7RTX7 472 aa21.89■■□□□ 1.1
NPAS1-201ENST00000439365 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa21.89■■□□□ 1.1
NPAS1-201ENST00000439365 TPH2Q8IWU9 490 aa21.89■■□□□ 1.1
NPAS1-201ENST00000439365 LRRC43Q8N309 656 aa21.89■■□□□ 1.1
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
NPAS1-201ENST00000439365 TNFRSF25Q93038 417 aa21.89■■□□□ 1.1
NPAS1-201ENST00000439365 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa21.89■■□□□ 1.1
NPAS1-201ENST00000439365 CWH43Q9H720 699 aa21.89■■□□□ 1.1
NPAS1-201ENST00000439365 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa21.89■■□□□ 1.1
NPAS1-201ENST00000439365 PCDHA12Q9UN75 941 aa21.89■■□□□ 1.1
NPAS1-201ENST00000439365 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.89■■□□□ 1.1
NPAS1-201ENST00000439365 KIAA1671Q9BY89 1806 aa21.89■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 A0A0U1RQF3 1178 aa21.88■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 ATP2B1P20020 1258 aa21.88■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 LTBRP36941 435 aa21.88■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 GUCY1B3Q02153 619 aa21.88■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 UBE3AQ05086 875 aa21.88■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 CTC1Q2NKJ3 1217 aa21.88■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 XKR9Q5GH70 373 aa21.88■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.88■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 C4orf19Q8IY42 314 aa21.88■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 GJD3Q8N144 294 aa21.88■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 HELQQ8TDG4 1101 aa21.88■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 TMEM143Q96AN5 459 aa21.88■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 TLR9Q9NR96 1032 aa21.88■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 CHST12Q9NRB3 414 aa21.88■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa21.88■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa21.88■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 NCOR1O75376 2440 aa21.88■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 MYO7AQ13402 2215 aa21.88■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 NEMFO60524 1076 aa21.87■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 EOMESO95936 686 aa21.87■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa21.87■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 RFC5P40937 340 aa21.87■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 TXKP42681 527 aa21.87■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 LONRF3Q496Y0 759 aa21.87■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 EPHX3Q9H6B9 360 aa21.87■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 TLE6Q9H808 572 aa21.87■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 CD320Q9NPF0 282 aa21.87■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 PPME1Q9Y570 386 aa21.87■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 PBX3P40426 434 aa21.86■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 ADAM15Q13444 863 aa21.86■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 CLLU1OSQ5K130 101 aa21.86■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 LRRC55Q6ZSA7 311 aa21.86■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF558Q96NG5 402 aa21.86■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 RNF19AQ9NV58 838 aa21.86■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 ZBTB39O15060 712 aa21.85■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 TBX10O75333 385 aa21.85■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 COL9A1P20849 921 aa21.85■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 PHKA2P46019 1235 aa21.85■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 KRT17Q04695 432 aa21.85■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 SPIRE1Q08AE8 756 aa21.85■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 ST3GAL1Q11201 340 aa21.85■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 EMC2Q15006 297 aa21.85■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 KCNT2Q6UVM3 1135 aa21.85■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 TCP11Q8WWU5 503 aa21.85■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa21.85■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 CD207Q9UJ71 328 aa21.85■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 PER2O15055 1255 aa21.84■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 SLITRK3O94933 977 aa21.84■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 SKIP12755 728 aa21.84■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 PPM1AP35813 382 aa21.84■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 ERVFC1P60507 584 aa21.84■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa21.84■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 PLPP4Q5VZY2 271 aa21.84■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 EFHBQ8N7U6 833 aa21.84■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 LPPQ93052 612 aa21.84■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 C8orf76Q96K31 380 aa21.84■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 MTRQ99707 1265 aa21.84■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 IFT122Q9HBG6 1241 aa21.84■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa21.84■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 GAS2O43903 313 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 MCM7P33993 719 aa21.83■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 TCF25Q9BQ70 676 aa21.83■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 FAM105AQ9NUU6 356 aa21.83■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 SPG21Q9NZD8 308 aa21.83■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa21.83■■□□□ 1.09
NPAS1-201ENST00000439365 WNT7AO00755 349 aa21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms