RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439009.1

LINC00578-201, long intergenic non-protein coding RNA 578, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LINC00578, Length 542 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00578-201ENST00000439009 KANK3Q6NY19 840 aa8.93□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa8.93□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 GPR149Q86SP6 731 aa8.93□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 PPFIBP1Q86W92 1011 aa8.93□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 MICU3Q86XE3 530 aa8.93□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa8.93□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 CKAP2LQ8IYA6 745 aa8.93□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 CCDC105Q8IYK2 499 aa8.93□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 ADSSL1Q8N142 457 aa8.93□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 HELQQ8TDG4 1101 aa8.93□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 TMEM169Q96HH4 297 aa8.93□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 IGSF21Q96ID5 467 aa8.93□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 CCDC136Q96JN2 1154 aa8.93□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 MAP7D2Q96T17 732 aa8.93□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 RTP3Q9BQQ7 232 aa8.93□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF577Q9BSK1 485 aa8.93□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa8.93□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 SEMA4AQ9H3S1 761 aa8.93□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 NRBP2Q9NSY0 501 aa8.93□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 DACT1Q9NYF0 836 aa8.93□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 GABBR1Q9UBS5 961 aa8.93□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 STK39Q9UEW8 545 aa8.93□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 BRPF3Q9ULD4 1205 aa8.93□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 AKT3Q9Y243 479 aa8.93□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 PAPLNO95428 1278 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 OATP04181 439 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 GALTP07902 379 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 PHKA2P46019 1235 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 TDGQ13569 410 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 RTN1Q16799 776 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 TSGA10IPQ3SY00 556 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 OTOP3Q7RTS5 596 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 CABP7Q86V35 215 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 LRRC71Q8N4P6 559 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 DTWD2Q8NBA8 298 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 LENG9Q96B70 501 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 CEP89Q96ST8 783 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 VN1R3Q9BXE9 311 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 LRRC2Q9BYS8 371 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 ZMYND12Q9H0C1 365 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 MFSD1Q9H3U5 465 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 SFXN1Q9H9B4 322 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 KCNK12Q9HB15 430 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 IGSF9Q9P2J2 1179 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 DUSP12Q9UNI6 340 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 NCOR2Q9Y618 2525 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 EPG5Q9HCE0 2579 aa8.91□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 WDR64B1ANS9 1081 aa8.91□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 ADAMTS3O15072 1205 aa8.91□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 ZBTB43O43298 467 aa8.91□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 EDIL3O43854 480 aa8.91□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 OFD1O75665 1012 aa8.91□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 SKIP12755 728 aa8.91□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP8.91□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 CLCN4P51793 760 aa8.91□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 ANGPT1Q15389 498 aa8.91□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 PTPN14Q15678 1187 aa8.91□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 NOMO2Q5JPE7 1267 aa8.91□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa8.91□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 TMC5Q6UXY8 1006 aa8.91□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 CYP26C1Q6V0L0 522 aa8.91□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 RNF169Q8NCN4 708 aa8.91□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 FEZF2Q8TBJ5 459 aa8.91□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 AUTS2Q8WXX7 1259 aa8.91□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 RIT2Q99578 217 aa8.91□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa8.91□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 DISC1Q9NRI5 854 aa8.91□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 TBC1D13Q9NVG8 400 aa8.91□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 WNT16Q9UBV4 365 aa8.91□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 MYO10Q9HD67 2058 aa8.9□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 FRYLO94915 3013 aa8.9□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 DMXL1Q9Y485 3027 aa8.9□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP8.9□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 STBD1O95210 358 aa8.9□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 EFEMP2O95967 443 aa8.9□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 C1RP00736 705 aa8.9□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 FGFR4P22455 802 aa8.9□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 CDC27P30260 824 aa8.9□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 SFNP31947 248 aa8.9□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 RAB27AP51159 221 aa8.9□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 PRKCEQ02156 737 aa8.9□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa8.9□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 LETM2Q2VYF4 491 aa8.9□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 PRR16Q569H4 304 aa8.9□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 GLB1LQ6UWU2 654 aa8.9□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 B3GNT9Q6UX72 402 aa8.9□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 CCDC149Q6ZUS6 474 aa8.9□□□□□ -0.98
LINC00578-201ENST00000439009 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.9 ms