RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437840.6

RGL2-238, Transcript of ral guanine nucleotide dissociation stimulator like 2, human

TSL 1 (best)

Gene RGL2, Length 2,687 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RGL2-238	ENST00000437840	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		16.02	■□□□□ 0.16
RGL2-238	ENST00000437840	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	16.02	■□□□□ 0.16
RGL2-238	ENST00000437840	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		16.02	■□□□□ 0.16
RGL2-238	ENST00000437840	KLC4	Q9NSK0	619 aa		16.02	■□□□□ 0.16
RGL2-238	ENST00000437840	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		16.02	■□□□□ 0.16
RGL2-238	ENST00000437840	COG5	Q9UP83	839 aa		16.02	■□□□□ 0.16
RGL2-238	ENST00000437840	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		16.02	■□□□□ 0.16
RGL2-238	ENST00000437840	FAM196B	A6NMK8	535 aa		16.02	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	ABCB4	P21439	1286 aa		16.02	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	DRD4	P21917	467 aa		16.02	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	16.02	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	COG2	Q14746	738 aa		16.02	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		16.02	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		16.02	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	FBXO11	Q86XK2	927 aa		16.02	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	PALB2	Q86YC2	1186 aa		16.02	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		16.02	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	16.02	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		16.02	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	SIPA1L1	O43166	1804 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	FAM187A	A6NFU0	413 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	CAND2	O75155	1236 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	COPB2	P35606	906 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	16.01	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	GLG1	Q92896	1179 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	THAP2	Q9H0W7	228 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	ANKRD62	A6NC57	917 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840		F5H6K3	240 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	16.01	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	SLITRK3	O94933	977 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	SHBG	P04278	402 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	16.01	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	VCAM1	P19320	739 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	16.01	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	USH1G	Q495M9	461 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	16.01	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	TEKT1	Q969V4	418 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	16.01	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	16.01	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		16	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		16	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	FAM13A	O94988	1023 aa		16	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	ZNF131	P52739	623 aa		16	■□□□□ 0.15
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RGL2-238	ENST00000437840	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
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RGL2-238	ENST00000437840	MYCT1	Q8N699	235 aa		16	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	MDM1	Q8TC05	714 aa		16	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	16	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	16	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	MAPK7	Q13164	816 aa		16	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	16	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	PPP2R5A	Q15172	486 aa		16	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		16	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		16	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		16	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	JAML	Q86YT9	394 aa		16	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	KSR1	Q8IVT5	923 aa		16	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	16	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	PGM2	Q96G03	612 aa		16	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	GMCL1	Q96IK5	515 aa		16	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	16	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
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RGL2-238	ENST00000437840	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		16	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		16	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	PNMA2	Q9UL42	364 aa		16	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		15.99	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	ZBTB39	O15060	712 aa		15.99	■□□□□ 0.15
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RGL2-238	ENST00000437840	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		15.99	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	HOOK3	Q86VS8	718 aa		15.99	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		15.99	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		15.99	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	LMO3	Q8TAP4	145 aa		15.99	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	CCT6B	Q92526	530 aa		15.99	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	CCDC114	Q96M63	670 aa		15.99	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		15.99	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	15.99	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		15.99	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	UBE4B	O95155	1302 aa		15.99	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		15.99	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	CHUK	O15111	745 aa		15.99	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	TRIM49	P0CI25	452 aa		15.99	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	TRIM49C	P0CI26	452 aa		15.99	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	MMP13	P45452	471 aa		15.99	■□□□□ 0.15
RGL2-238	ENST00000437840	PMS2	P54278	862 aa		15.99	■□□□□ 0.15

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