RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 CRKP46108 304 aa16.16■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 ARSHQ5FYA8 562 aa16.16■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 CROCCP2Q86T23 111 aa16.16■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 RFFLQ8WZ73 363 aa16.16■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 TBC1D31Q96DN5 1066 aa16.16■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 EBF2Q9HAK2 575 aa16.16■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 OSGEPQ9NPF4 335 aa16.16■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
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TOP3B-206ENST00000436282 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 CALUO43852 315 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
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TOP3B-206ENST00000436282 SLC12A3P55017 1021 aa16.16■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 DRG2P55039 364 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 SLC8A3P57103 927 aa16.16■□□□□ 0.18
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TOP3B-206ENST00000436282 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 AZI2Q9H6S1 392 aa16.16■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
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TOP3B-206ENST00000436282 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa16.16■□□□□ 0.18
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TOP3B-206ENST00000436282 SNAP25P60880 206 aa16.15■□□□□ 0.18
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TOP3B-206ENST00000436282 SLC30A5Q8TAD4 765 aa16.15■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 SLC35G2Q8TBE7 412 aa16.15■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 TCP11Q8WWU5 503 aa16.15■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
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TOP3B-206ENST00000436282 CLUL1Q15846 466 aa16.15■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 ACCSLQ4AC99 568 aa16.15■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 C6orf118Q5T5N4 469 aa16.15■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 TCERG1LQ5VWI1 586 aa16.15■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 CHADLQ6NUI6 762 aa16.15■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 ZDHHC24Q6UX98 284 aa16.15■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 JAMLQ86YT9 394 aa16.15■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 NLGN1Q8N2Q7 840 aa16.15■□□□□ 0.18
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TOP3B-206ENST00000436282 RPSAP08865 295 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
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TOP3B-206ENST00000436282 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
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TOP3B-206ENST00000436282 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 MAB21L3Q8N8X9 362 aa16.14■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 OLIG1Q8TAK6 271 aa16.14■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 FAXDC2Q96IV6 333 aa16.14■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 CLTAP09496 248 aa16.14■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 EEF2P13639 858 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 MAPK7Q13164 816 aa16.14■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 SLC29A2Q14542 456 aa16.14■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 FBXO25Q8TCJ0 367 aa16.14■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 GLG1Q92896 1179 aa16.14■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 SLC35C1Q96A29 364 aa16.14■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 FAM212AQ96EL1 285 aa16.14■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa16.14■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 DNAJC18Q9H819 358 aa16.14■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP16.14■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 EVI5O60447 810 aa16.13■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 RTN2O75298 545 aa16.13■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 MED24O75448 989 aa16.13■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 COPB2P35606 906 aa16.13■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 HHIPL2Q6UWX4 724 aa16.13■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 FMNL3Q8IVF7 1028 aa16.13■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM109Q9BVC6 243 aa16.13■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 SNX24Q9Y343 169 aa16.13■□□□□ 0.17
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