RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 CLUL1Q15846 466 aa23.37■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 CLLU1OSQ5K130 101 aa23.37■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 THNSL1Q8IYQ7 743 aa23.37■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 TNFRSF25Q93038 417 aa23.37■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 GTF3C6Q969F1 213 aa23.37■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 SH2D3AQ9BRG2 576 aa23.37■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 CYP26B1Q9NR63 512 aa23.37■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 A0A087WZ62 844 aa23.36■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.36■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 COASYQ13057 564 aa23.36■■□□□ 1.33
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UBXN4-204ENST00000426921 PLA2G4FQ68DD2 849 aa23.36■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 ABI1Q8IZP0 508 aa23.36■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 SMRP1Q8NCR6 262 aa23.36■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 RSPH1Q8WYR4 309 aa23.36■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
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UBXN4-204ENST00000426921 LARGE1O95461 756 aa23.35■■□□□ 1.33
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UBXN4-204ENST00000426921 ALADP13716 330 aa23.35■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 PPM1AP35813 382 aa23.35■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 ERVFC1P60507 584 aa23.35■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 SPIRE1Q08AE8 756 aa23.35■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 ME3Q16798 604 aa23.35■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 KCNT2Q6UVM3 1135 aa23.35■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 POTEDQ86YR6 584 aa23.35■■□□□ 1.33
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UBXN4-204ENST00000426921 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
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UBXN4-204ENST00000426921 EPHA7Q15375 998 aa23.34■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 DUSP6Q16828 381 aa23.34■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
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UBXN4-204ENST00000426921 C4orf19Q8IY42 314 aa23.34■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 SLFN12Q8IYM2 578 aa23.34■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF558Q96NG5 402 aa23.34■■□□□ 1.33
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UBXN4-204ENST00000426921 TLE6Q9H808 572 aa23.34■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 FAM205CA6NFA0 338 aa23.33■■□□□ 1.33
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UBXN4-204ENST00000426921 NECAB1Q8N987 351 aa23.33■■□□□ 1.33
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UBXN4-204ENST00000426921 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa23.33■■□□□ 1.33
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UBXN4-204ENST00000426921 BRMS1Q9HCU9 246 aa23.33■■□□□ 1.33
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UBXN4-204ENST00000426921 RFC5P40937 340 aa23.32■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 NPEPPSP55786 919 aa23.32■■□□□ 1.32
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UBXN4-204ENST00000426921 RNF169Q8NCN4 708 aa23.32■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 VN1R2Q8NFZ6 395 aa23.32■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 HELQQ8TDG4 1101 aa23.32■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 CEP170P1Q96L14 293 aa23.32■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 NLRP4Q96MN2 994 aa23.32■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa23.32■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 PRR33A8MZF0 331 aa23.31■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 GAS2O43903 313 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 SKIP12755 728 aa23.31■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa23.31■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 KSR1Q8IVT5 923 aa23.31■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 SLC39A11Q8N1S5 342 aa23.31■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 TCF25Q9BQ70 676 aa23.31■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 SPG21Q9NZD8 308 aa23.31■■□□□ 1.32
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UBXN4-204ENST00000426921 ZNF623O75123 536 aa23.3■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 YWHABP31946 246 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
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UBXN4-204ENST00000426921 RAB27AP51159 221 aa23.3■■□□□ 1.32
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UBXN4-204ENST00000426921 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa23.3■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa23.3■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 FAM105AQ9NUU6 356 aa23.3■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 RGL1Q9NZL6 768 aa23.3■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa23.3■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 ARID2Q68CP9 1835 aa23.3■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 BAG4O95429 457 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 PLA2G5P39877 138 aa23.29■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 KRT17Q04695 432 aa23.29■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 PLPP4Q5VZY2 271 aa23.29■■□□□ 1.32
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