RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 AK8Q96MA6 479 aa20.03■□□□□ 0.8
HERC3-205ENST00000426683 USP28Q96RU2 1077 aa20.03■□□□□ 0.8
HERC3-205ENST00000426683 GPRC5CQ9NQ84 441 aa20.03■□□□□ 0.8
HERC3-205ENST00000426683 LRFN2Q9ULH4 789 aa20.03■□□□□ 0.8
HERC3-205ENST00000426683 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa20.03■□□□□ 0.8
HERC3-205ENST00000426683 LINC01553A4QN01 128 aa20.02■□□□□ 0.8
HERC3-205ENST00000426683 C9IYK1 514 aa20.02■□□□□ 0.8
HERC3-205ENST00000426683 EYA4O95677 639 aa20.02■□□□□ 0.8
HERC3-205ENST00000426683 CYP11B2P19099 503 aa20.02■□□□□ 0.8
HERC3-205ENST00000426683 GLRA2P23416 452 aa20.02■□□□□ 0.8
HERC3-205ENST00000426683 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
HERC3-205ENST00000426683 LONP1P36776 959 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
HERC3-205ENST00000426683 TFDP1Q14186 410 aa20.02■□□□□ 0.8
HERC3-205ENST00000426683 FAM102BQ5T8I3 360 aa20.02■□□□□ 0.8
HERC3-205ENST00000426683 CATSPER4Q7RTX7 472 aa20.02■□□□□ 0.8
HERC3-205ENST00000426683 SPRED2Q7Z698 418 aa20.02■□□□□ 0.8
HERC3-205ENST00000426683 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa20.02■□□□□ 0.8
HERC3-205ENST00000426683 CABP7Q86V35 215 aa20.02■□□□□ 0.8
HERC3-205ENST00000426683 CRIPAKQ8N1N5 446 aa20.02■□□□□ 0.8
HERC3-205ENST00000426683 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa20.02■□□□□ 0.8
HERC3-205ENST00000426683 PNMA5Q96PV4 448 aa20.02■□□□□ 0.8
HERC3-205ENST00000426683 PLIN2Q99541 437 aa20.02■□□□□ 0.8
HERC3-205ENST00000426683 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa20.02■□□□□ 0.8
HERC3-205ENST00000426683 DGKIO75912 1065 aa20.01■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 UBA7P41226 1012 aa20.01■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 PHKA2P46019 1235 aa20.01■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 GRB10Q13322 594 aa20.01■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 CAPSQ13938 189 aa20.01■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 HYIQ5T013 277 aa20.01■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 KCNK18Q7Z418 384 aa20.01■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 ARNTL2Q8WYA1 636 aa20.01■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 NT5C3AQ9H0P0 336 aa20.01■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 MINDY3Q9H8M7 445 aa20.01■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa20.01■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 F13A1P00488 732 aa20■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 PTENP60484 403 aa20■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 FAM189BP81408 668 aa20■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 PKP1Q13835 747 aa20■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 CHST12Q9NRB3 414 aa20■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 MTUS1Q9ULD2 1270 aa20■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa20■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 SLC26A4O43511 780 aa19.99■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 FOSL2P15408 326 aa19.99■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 ERVK-21P61565 698 aa19.99■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 POU5F1BQ06416 359 aa19.99■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 BECN1Q14457 450 aa19.99■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 TMEM119Q4V9L6 283 aa19.99■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 KCTD17Q8N5Z5 321 aa19.99■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 CALML4Q96GE6 196 aa19.99■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 CSRNP2Q9H175 543 aa19.99■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 TMEM161AQ9NX61 479 aa19.99■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 DACT1Q9NYF0 836 aa19.99■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 EPOPA6NHQ4 379 aa19.98■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 LRRIQ4A6NIV6 560 aa19.98■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa19.98■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 RFXAPO00287 272 aa19.98■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 NASPP49321 788 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 GATMP50440 423 aa19.98■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 SLC39A14Q15043 492 aa19.98■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 ECHDC2Q86YB7 292 aa19.98■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 FIBCD1Q8N539 461 aa19.98■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 RASSF8Q8NHQ8 419 aa19.98■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 BSNDQ8WZ55 320 aa19.98■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 C17orf80Q9BSJ5 609 aa19.98■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 POLD4Q9HCU8 107 aa19.98■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa19.98■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 TTC3P53804 2025 aa19.98■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 COL4A6Q14031 1691 aa19.97■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 A0A0U1RQF3 1178 aa19.97■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 ERLIN2O94905 339 aa19.97■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP19.97■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 MBTD1Q05BQ5 628 aa19.97■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 ADGRE1Q14246 886 aa19.97■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 STK38Q15208 465 aa19.97■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 SPECC1Q5M775 1068 aa19.97■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 RINT1Q6NUQ1 792 aa19.97■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 CLIC6Q96NY7 704 aa19.97■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 RUSC1Q9BVN2 902 aa19.97■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 NFKBIZQ9BYH8 718 aa19.97■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 PLA2G4BP0C869 781 aa19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms