RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420484.2

CIZ1-209, Transcript of CDKN1A interacting zinc finger protein 1, human

TSL 3

Gene CIZ1, Length 684 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIZ1-209	ENST00000420484	XKR9	Q5GH70	373 aa		33.2	■■■□□ 2.91
CIZ1-209	ENST00000420484	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	33.2	■■■□□ 2.91
CIZ1-209	ENST00000420484	NLRP4	Q96MN2	994 aa		33.2	■■■□□ 2.91
CIZ1-209	ENST00000420484	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		33.2	■■■□□ 2.91
CIZ1-209	ENST00000420484	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		33.2	■■■□□ 2.91
CIZ1-209	ENST00000420484	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	33.2	■■■□□ 2.91
CIZ1-209	ENST00000420484	CHST12	Q9NRB3	414 aa		33.2	■■■□□ 2.91
CIZ1-209	ENST00000420484	DACT1	Q9NYF0	836 aa		33.2	■■■□□ 2.91
CIZ1-209	ENST00000420484	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		33.2	■■■□□ 2.91
CIZ1-209	ENST00000420484		A0A0U1RQF3	1178 aa		33.19	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	HOXA2	O43364	376 aa		33.19	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	33.19	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	MCM7	P33993	719 aa		33.19	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		33.19	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		33.19	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	TMEM143	Q96AN5	459 aa		33.19	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	CASD1	Q96PB1	797 aa		33.19	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		33.19	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	HCST	Q9UBK5	93 aa		33.19	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		33.19	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	LYPLA2	O95372	231 aa		33.18	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	RABEP1	Q15276	862 aa		33.18	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	NEK9	Q8TD19	979 aa		33.18	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	CWH43	Q9H720	699 aa		33.18	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	AAAS	Q9NRG9	546 aa		33.18	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	CSPG5	O95196	566 aa		33.17	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	EOMES	O95936	686 aa		33.17	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	EMC2	Q15006	297 aa		33.17	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	RNF169	Q8NCN4	708 aa		33.17	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	POF1B	Q8WVV4	589 aa		33.17	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		33.16	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		33.16	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	TCP11	Q8WWU5	503 aa		33.16	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	NCK2	O43639	380 aa		33.15	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		33.15	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	HYAL1	Q12794	435 aa		33.15	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		33.15	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		33.15	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		33.15	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		33.15	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	POTEM	A6NI47	508 aa		33.14	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		33.14	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	ABI1	Q8IZP0	508 aa		33.14	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	MTR	Q99707	1265 aa		33.14	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	CLDND1	Q9NY35	253 aa		33.14	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
CIZ1-209	ENST00000420484		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	ASAP2	O43150	1006 aa		33.13	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	LAG3	P18627	525 aa		33.13	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	IRS1	P35568	1242 aa		33.13	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	PHKA2	P46019	1235 aa		33.13	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	ZNF174	Q15697	407 aa		33.13	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		33.13	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		33.13	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	FERMT3	Q86UX7	667 aa		33.13	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		33.13	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		33.13	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	ST18	O60284	1047 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	FGF18	O76093	207 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	UBE3A	Q05086	875 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	LRRC43	Q8N309	656 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	33.11	■■■□□ 2.89	7e-8	■■■■□ 23.1
CIZ1-209	ENST00000420484	LTBR	P36941	435 aa		33.11	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		33.11	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	IGFLR1	Q9H665	355 aa		33.11	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		33.1	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	33.1	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	TTC38	Q5R3I4	469 aa		33.1	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		33.1	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	RNF149	Q8NC42	400 aa		33.1	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		33.1	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		33.1	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484		A0A087WWV3	80 aa		33.09	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	DGAT1	O75907	488 aa		33.09	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	OR52Z1	P0C646	297 aa		33.09	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	SKI	P12755	728 aa		33.09	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	33.09	■■■□□ 2.89	8e-6	■■■□□ 17.9
CIZ1-209	ENST00000420484	TEC	P42680	631 aa		33.09	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	RARRES1	P49788	294 aa		33.09	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		33.09	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		33.09	■■■□□ 2.89
CIZ1-209	ENST00000420484	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		33.08	■■■□□ 2.89

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