RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419348.6

HTATIP2-201, Transcript of HIV-1 Tat interactive protein 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HTATIP2, Length 1,477 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATIP2-201ENST00000419348 WDR5P61964 334 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 KRT85P78386 507 aa24.37■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 KARSQ15046 597 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 NLRP4Q96MN2 994 aa24.37■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 ERVK-5Q9HDB9 667 aa24.37■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa24.37■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 SIP14410 1827 aa24.37■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa24.36■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 MAEAQ7L5Y9 396 aa24.36■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 FAM228AQ86W67 206 aa24.36■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 SLC9A7Q96T83 725 aa24.36■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa24.35■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 PLA2G4BP0C869 781 aa24.35■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 PLCG1P19174 1290 aa24.35■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 POU5F1BQ06416 359 aa24.35■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 TFDP1Q14186 410 aa24.35■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 FAM102BQ5T8I3 360 aa24.35■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 IFT122Q9HBG6 1241 aa24.35■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 NCLP19338 710 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 ME1P48163 572 aa24.34■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 RINT1Q6NUQ1 792 aa24.34■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 RNF149Q8NC42 400 aa24.34■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa24.34■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 SLC28A3Q9HAS3 691 aa24.34■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 GPRC5CQ9NQ84 441 aa24.34■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa24.34■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 ENPP3O14638 875 aa24.33■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 AMHP03971 560 aa24.33■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 GLRA2P23416 452 aa24.33■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 SLC12A3P55017 1021 aa24.33■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 C1orf186Q6ZWK4 172 aa24.33■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa24.33■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 ASAP3Q8TDY4 903 aa24.33■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 KIFAP3Q92845 792 aa24.33■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 TIPINQ9BVW5 301 aa24.33■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa24.33■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 KCND2Q9NZV8 630 aa24.33■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 PCDHA7Q9UN72 937 aa24.33■■□□□ 1.49
HTATIP2-201ENST00000419348 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 PHKA2P46019 1235 aa24.32■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 RABGGTBP53611 331 aa24.32■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 PTENP60484 403 aa24.32■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 DEFB103AP81534 67 aa24.32■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 RRAGBQ5VZM2 374 aa24.32■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 RAD54LQ92698 747 aa24.32■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 SPATA32Q96LK8 384 aa24.32■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 TMX1Q9H3N1 280 aa24.32■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 PRDM12Q9H4Q4 367 aa24.32■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 STK17AQ9UEE5 414 aa24.32■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 GUCY2CP25092 1073 aa24.32■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 CAPSQ13938 189 aa24.32■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa24.32■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 RUSC1Q9BVN2 902 aa24.32■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa24.32■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 HERC6Q8IVU3 1022 aa24.31■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 LRRC15Q8TF66 581 aa24.31■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 CHAMP1Q96JM3 812 aa24.31■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 NFKBIZQ9BYH8 718 aa24.31■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 FGFR4P22455 802 aa24.3■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 MCM6Q14566 821 aa24.3■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 PPP2R5AQ15172 486 aa24.3■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 SHC4Q6S5L8 630 aa24.3■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 MYOCDQ8IZQ8 938 aa24.3■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 TOP1MTQ969P6 601 aa24.3■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 IFT74Q96LB3 600 aa24.3■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 DRC1Q96MC2 740 aa24.3■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 ADAM2Q99965 735 aa24.3■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 MICAL3Q7RTP6 2002 aa24.3■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 DENND3A2RUS2 1198 aa24.29■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 MYOGP15173 224 aa24.29■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 DSC3Q14574 896 aa24.29■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 CATSPER4Q7RTX7 472 aa24.29■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 LINC01599Q8WXQ3 324 aa24.29■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 PANK2Q9BZ23 570 aa24.29■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 MINDY3Q9H8M7 445 aa24.29■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 POLD4Q9HCU8 107 aa24.29■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 CHST12Q9NRB3 414 aa24.29■■□□□ 1.48
HTATIP2-201ENST00000419348 RGS18Q9NS28 235 aa24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms