RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CYP11B2P19099 503 aa19.28■□□□□ 0.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PHKA2P46019 1235 aa19.28■□□□□ 0.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GRIN1Q05586 938 aa19.28■□□□□ 0.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC39A14Q15043 492 aa19.28■□□□□ 0.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STK38Q15208 465 aa19.28■□□□□ 0.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM102BQ5T8I3 360 aa19.28■□□□□ 0.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAEAQ7L5Y9 396 aa19.28■□□□□ 0.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 YME1L1Q96TA2 773 aa19.28■□□□□ 0.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADAM2Q99965 735 aa19.28■□□□□ 0.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF576Q9H609 170 aa19.28■□□□□ 0.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C1orf112Q9NSG2 853 aa19.28■□□□□ 0.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 INSL6Q9Y581 213 aa19.28■□□□□ 0.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MGEA5O60502 916 aa19.27■□□□□ 0.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FGFR4P22455 802 aa19.27■□□□□ 0.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARL2P36404 184 aa19.27■□□□□ 0.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa19.27■□□□□ 0.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ASAP3Q8TDY4 903 aa19.27■□□□□ 0.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PNMA5Q96PV4 448 aa19.27■□□□□ 0.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CSRNP2Q9H175 543 aa19.27■□□□□ 0.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IFT122Q9HBG6 1241 aa19.27■□□□□ 0.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPRC5CQ9NQ84 441 aa19.27■□□□□ 0.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RGS18Q9NS28 235 aa19.27■□□□□ 0.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARID2Q68CP9 1835 aa19.26■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 YEATS4O95619 227 aa19.26■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STAG3L1P0CL83 205 aa19.26■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GLRA2P23416 452 aa19.26■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TXLNAP40222 546 aa19.26■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SARSP49591 514 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 POU5F1BQ06416 359 aa19.26■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GRB10Q13322 594 aa19.26■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CAPSQ13938 189 aa19.26■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM119Q4V9L6 283 aa19.26■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC24A5Q71RS6 500 aa19.26■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CATSPER4Q7RTX7 472 aa19.26■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KCNK18Q7Z418 384 aa19.26■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NPAS4Q8IUM7 802 aa19.26■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LINC00301Q8NCQ3 95 aa19.26■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLIN2Q99541 437 aa19.26■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPTLC2O15270 562 aa19.25■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BRD1O95696 1058 aa19.25■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP19.25■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DSC3Q14574 896 aa19.25■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATL3Q6DD88 541 aa19.25■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIFAP3Q92845 792 aa19.25■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCSER1Q9C0I3 900 aa19.25■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CHST12Q9NRB3 414 aa19.25■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DACT1Q9NYF0 836 aa19.25■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRFN2Q9ULH4 789 aa19.25■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MICAL3Q7RTP6 2002 aa19.25■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EVPLQ92817 2033 aa19.24■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LCHNA4D1U4 455 aa19.24■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRRIQ4A6NIV6 560 aa19.24■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ERLIN2O94905 339 aa19.24■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PTENP60484 403 aa19.24■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KARSQ15046 597 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPP2R5AQ15172 486 aa19.24■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP19.24■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPECC1Q5M775 1068 aa19.24■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CLIC6Q96NY7 704 aa19.24■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NFKBIZQ9BYH8 718 aa19.24■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC39Q9UFE4 941 aa19.24■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CFAP45Q9UL16 551 aa19.24■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C9IYK1 514 aa19.23■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa19.23■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPP6R2O75170 966 aa19.23■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLA2G4BP0C869 781 aa19.23■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLCG1P19174 1290 aa19.23■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TAP1Q03518 808 aa19.23■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RINT1Q6NUQ1 792 aa19.23■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa19.23■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KCNG4Q8TDN1 519 aa19.23■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EPSTI1Q96J88 318 aa19.23■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IFT74Q96LB3 600 aa19.23■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RUSC1Q9BVN2 902 aa19.23■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TIPINQ9BVW5 301 aa19.23■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MINDY3Q9H8M7 445 aa19.23■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa19.23■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KCND2Q9NZV8 630 aa19.23■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa19.23■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NAMPTP43490 491 aa19.22■□□□□ 0.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms