RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411961.6

ANKRD54-204, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ANKRD54, Length 946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-204ENST00000411961 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
ANKRD54-204ENST00000411961 KIAA1671Q9BY89 1806 aa21.9■■□□□ 1.1
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ANKRD54-204ENST00000411961 ZBTB39O15060 712 aa21.9■■□□□ 1.1
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ANKRD54-204ENST00000411961 CATSPER4Q7RTX7 472 aa21.9■■□□□ 1.1
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ANKRD54-204ENST00000411961 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
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ANKRD54-204ENST00000411961 NCK2O43639 380 aa21.89■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 EOMESO95936 686 aa21.89■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 KCNA5P22460 613 aa21.89■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 EMC2Q15006 297 aa21.89■■□□□ 1.09
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ANKRD54-204ENST00000411961 NOSTRINQ8IVI9 506 aa21.89■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 PPP2R3CQ969Q6 453 aa21.89■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 HSD17B14Q9BPX1 270 aa21.89■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 TMEM60Q9H2L4 133 aa21.89■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 REV3LO60673 3130 aa21.88■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 A0A0U1RQF3 1178 aa21.88■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 ITGB1P05556 798 aa21.88■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 SKIP12755 728 aa21.88■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa21.88■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa21.88■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 TTC38Q5R3I4 469 aa21.88■■□□□ 1.09
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ANKRD54-204ENST00000411961 SPPL3Q8TCT6 385 aa21.88■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 POTEMA6NI47 508 aa21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 LYPLA2O95372 231 aa21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 OR52Z1P0C646 297 aa21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 LAG3P18627 525 aa21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 TECP42680 631 aa21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 THNSL1Q8IYQ7 743 aa21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 POF1BQ8WVV4 589 aa21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 CASD1Q96PB1 797 aa21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 ARID2Q68CP9 1835 aa21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 TRAPPC10P48553 1259 aa21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 MCM2P49736 904 aa21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 TFDP1Q14186 410 aa21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 LEXMQ3ZCV2 418 aa21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 FERMT3Q86UX7 667 aa21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 LRRC43Q8N309 656 aa21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 RNF149Q8NC42 400 aa21.86■■□□□ 1.09
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ANKRD54-204ENST00000411961 IGFLR1Q9H665 355 aa21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 IFT122Q9HBG6 1241 aa21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 TUFT1Q9NNX1 390 aa21.86■■□□□ 1.09
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ANKRD54-204ENST00000411961 DGAT1O75907 488 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 PHKA2P46019 1235 aa21.85■■□□□ 1.09
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ANKRD54-204ENST00000411961 HELQQ8TDG4 1101 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 TMX3Q96JJ7 454 aa21.85■■□□□ 1.09
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ANKRD54-204ENST00000411961 CWH43Q9H720 699 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 FGF18O76093 207 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 DNAJB1P25685 340 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 RAB27AP51159 221 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 UBE3AQ05086 875 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 MCTP1Q6DN14 999 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 PGBD4Q96DM1 585 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 ZNF558Q96NG5 402 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 NACC1Q96RE7 527 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 TRAIPQ9BWF2 469 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 RNF19AQ9NV58 838 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 HCSTQ9UBK5 93 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 A0A087WWV3 80 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 ERLIN2O94905 339 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.094e-7■■■□□ 18.8
ANKRD54-204ENST00000411961 RARRES1P49788 294 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 HYAL1Q12794 435 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 LONRF3Q496Y0 759 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 CLLU1OSQ5K130 101 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 CATSPER3Q86XQ3 398 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 FAM105AQ9NUU6 356 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-204ENST00000411961 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa21.83■■□□□ 1.08
ANKRD54-204ENST00000411961 H3BQ06 376 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
ANKRD54-204ENST00000411961 H3BQV1 296 aa21.82■■□□□ 1.08
ANKRD54-204ENST00000411961 KRT17Q04695 432 aa21.82■■□□□ 1.08
ANKRD54-204ENST00000411961 CAMK1Q14012 370 aa21.82■■□□□ 1.08
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