RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410062.8

UBE2E3-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-202ENST00000410062 PLCG1P19174 1290 aa26.47■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 GLRA2P23416 452 aa26.47■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 ODR4Q5SWX8 454 aa26.47■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 HERC6Q8IVU3 1022 aa26.47■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 FTHL17Q9BXU8 183 aa26.47■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 PBX4Q9BYU1 374 aa26.47■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 MGEA5O60502 916 aa26.46■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 NCLP19338 710 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
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UBE2E3-202ENST00000410062 FAM117BQ6P1L5 589 aa26.46■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 KCTD17Q8N5Z5 321 aa26.46■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 RUSC1Q9BVN2 902 aa26.46■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 PLA2G4BP0C869 781 aa26.46■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 RINT1Q6NUQ1 792 aa26.46■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 KCNG4Q8TDN1 519 aa26.46■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 UPP2O95045 317 aa26.45■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 MYOGP15173 224 aa26.45■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC12A3P55017 1021 aa26.45■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 MINDY3Q9H8M7 445 aa26.45■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa26.45■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa26.45■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 DNAJB2P25686 324 aa26.44■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 TXLNAP40222 546 aa26.44■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 NUCB2P80303 420 aa26.44■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 TFDP1Q14186 410 aa26.44■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 C1orf186Q6ZWK4 172 aa26.44■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 ADAM2Q99965 735 aa26.44■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 ZBED2Q9BTP6 218 aa26.44■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 CCDC39Q9UFE4 941 aa26.44■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 RCOR1Q9UKL0 485 aa26.44■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 DENND3A2RUS2 1198 aa26.43■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 CUTAO60888 179 aa26.43■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP26.43■■□□□ 1.824e-7■■■■□ 26
UBE2E3-202ENST00000410062 PHKA2P46019 1235 aa26.43■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 ME1P48163 572 aa26.43■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 KRT85P78386 507 aa26.43■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa26.43■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 BSNDQ8WZ55 320 aa26.43■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 TOP1MTQ969P6 601 aa26.43■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 GJB5O95377 273 aa26.42■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 PTENP60484 403 aa26.42■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa26.42■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 CATSPER4Q7RTX7 472 aa26.42■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 RAD54LQ92698 747 aa26.42■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 PANK2Q9BZ23 570 aa26.42■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 MSRAQ9UJ68 235 aa26.42■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 PCDHA7Q9UN72 937 aa26.42■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 TCHHQ07283 1943 aa26.42■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 LRRIQ4A6NIV6 560 aa26.41■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 TLL1O43897 1013 aa26.41■■□□□ 1.82
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UBE2E3-202ENST00000410062 MCM6Q14566 821 aa26.41■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 DSC3Q14574 896 aa26.41■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 RAB30Q15771 203 aa26.41■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 KIFAP3Q92845 792 aa26.41■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 RGS18Q9NS28 235 aa26.41■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa26.41■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 CDH23Q9H251 3354 aa26.41■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 TTC3P53804 2025 aa26.41■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 POU5F1BQ06416 359 aa26.41■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 RRAGBQ5VZM2 374 aa26.41■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 SHC4Q6S5L8 630 aa26.41■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 TIFAQ96CG3 184 aa26.41■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa26.41■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 CHD9Q3L8U1 2897 aa26.4■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 A0A087X0B3 334 aa26.4■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa26.4■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 ARSHQ5FYA8 562 aa26.4■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 DAW1Q8N136 415 aa26.4■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 SPATA32Q96LK8 384 aa26.4■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa26.39■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 GUCY2CP25092 1073 aa26.39■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 MAPK7Q13164 816 aa26.39■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 NAALADL2Q58DX5 795 aa26.39■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 GPBP1Q86WP2 473 aa26.39■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 PDILTQ8N807 584 aa26.39■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
UBE2E3-202ENST00000410062 SFI1A8K8P3 1242 aa26.38■■□□□ 1.81
UBE2E3-202ENST00000410062 CA3P07451 260 aa26.38■■□□□ 1.81
UBE2E3-202ENST00000410062 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
UBE2E3-202ENST00000410062 MBTD1Q05BQ5 628 aa26.38■■□□□ 1.81
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC24A5Q71RS6 500 aa26.38■■□□□ 1.81
UBE2E3-202ENST00000410062 IFT74Q96LB3 600 aa26.38■■□□□ 1.81
UBE2E3-202ENST00000410062 RAD9AQ99638 391 aa26.38■■□□□ 1.81
UBE2E3-202ENST00000410062 KIFC3Q9BVG8 833 aa26.38■■□□□ 1.81
UBE2E3-202ENST00000410062 NFKBIZQ9BYH8 718 aa26.38■■□□□ 1.81
UBE2E3-202ENST00000410062 C1orf112Q9NSG2 853 aa26.38■■□□□ 1.81
UBE2E3-202ENST00000410062 KCND2Q9NZV8 630 aa26.38■■□□□ 1.81
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