RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409006.3

KDELR3-202, Transcript of KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene KDELR3, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3-202ENST00000409006 ERVFC1P60507 584 aa25.2■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 CEP170P1Q96L14 293 aa25.2■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 NLRP4Q96MN2 994 aa25.2■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 C5orf42Q9H799 3197 aa25.2■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 PBX3P40426 434 aa25.19■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 NRIP1P48552 1158 aa25.19■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 CDC42EP1Q00587 391 aa25.19■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 CYP4A11Q02928 519 aa25.19■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF410Q86VK4 478 aa25.19■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 C4orf19Q8IY42 314 aa25.19■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 THNSL1Q8IYQ7 743 aa25.19■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 HELQQ8TDG4 1101 aa25.19■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 TMEM143Q96AN5 459 aa25.19■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 IFT122Q9HBG6 1241 aa25.19■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 BRMS1Q9HCU9 246 aa25.19■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 HOXA2O43364 376 aa25.18■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 MBTPS2O43462 519 aa25.18■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 LAG3P18627 525 aa25.18■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 YWHABP31946 246 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 UBE3AQ05086 875 aa25.18■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 SLFN12Q8IYM2 578 aa25.18■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 TLR9Q9NR96 1032 aa25.18■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 DACT1Q9NYF0 836 aa25.18■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 CLEC1BQ9P126 229 aa25.18■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 PER2O15055 1255 aa25.17■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 SLITRK3O94933 977 aa25.17■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 BAG4O95429 457 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 GLP2RO95838 553 aa25.17■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 EOMESO95936 686 aa25.17■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 RBM10P98175 930 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 KCNT2Q6UVM3 1135 aa25.17■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 ABI1Q8IZP0 508 aa25.17■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 LRRC43Q8N309 656 aa25.17■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 EFHBQ8N7U6 833 aa25.17■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa25.17■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 MSLNLQ96KJ4 702 aa25.17■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa25.17■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 C11orf16Q9NQ32 467 aa25.17■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 CHST12Q9NRB3 414 aa25.17■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa25.17■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 FSCN2O14926 492 aa25.16■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 PHKA2P46019 1235 aa25.16■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 NDUFV1P49821 464 aa25.16■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 GUCY1B3Q02153 619 aa25.16■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 ZP2Q05996 745 aa25.16■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 LONRF3Q496Y0 759 aa25.16■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 SLC7A3Q8WY07 619 aa25.16■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 LPPQ93052 612 aa25.16■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 PPP2R3CQ969Q6 453 aa25.16■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 MINDY3Q9H8M7 445 aa25.16■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 MEIS3P2A8K0S8 358 aa25.15■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 PI4K2BG5E9Z4 385 aa25.15■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 PLCB3Q01970 1234 aa25.15■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 CALCRLQ16602 461 aa25.15■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa25.15■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 XKR9Q5GH70 373 aa25.15■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 CATSPER4Q7RTX7 472 aa25.15■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 CCDC83Q8IWF9 413 aa25.15■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 TPH2Q8IWU9 490 aa25.15■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 VN1R2Q8NFZ6 395 aa25.15■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 KIF2CQ99661 725 aa25.15■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa25.15■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 TLE6Q9H808 572 aa25.15■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 CD207Q9UJ71 328 aa25.15■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 PCDHA12Q9UN75 941 aa25.15■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa25.14■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 RFC5P40937 340 aa25.14■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 EMC2Q15006 297 aa25.14■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF558Q96NG5 402 aa25.14■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 MTMR9Q96QG7 549 aa25.14■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 HSD17B14Q9BPX1 270 aa25.14■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 LRFN3Q9BTN0 628 aa25.14■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 TRAIPQ9BWF2 469 aa25.14■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 TMEM60Q9H2L4 133 aa25.14■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa25.14■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 FAM50BQ9Y247 325 aa25.14■■□□□ 1.62
KDELR3-202ENST00000409006 FAM86C2PA6NEL3 165 aa25.13■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 C19orf67A6NJJ6 358 aa25.13■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 TXKP42681 527 aa25.13■■□□□ 1.61
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