RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404424.5

CLIP4-204, Transcript of CAP-Gly domain containing linker protein family member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLIP4, Length 2,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4-204ENST00000404424 GMNCA6NCL1 334 aa11.64□□□□□ -0.55
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CLIP4-204ENST00000404424 PAEPP09466 180 aa11.64□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 BCRP11274 1271 aa11.64□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 PDE6BP35913 854 aa11.64□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 STAT2P52630 851 aa11.64□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 DRP2Q13474 957 aa11.64□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 KIF22Q14807 665 aa11.64□□□□□ -0.55
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CLIP4-204ENST00000404424 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa11.64□□□□□ -0.55
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CLIP4-204ENST00000404424 HSPA6P17066 643 aa11.63□□□□□ -0.55
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CLIP4-204ENST00000404424 POLD1P28340 1107 aa11.63□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 FLT3P36888 993 aa11.63□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 CDR1P51861 262 aa11.63□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 SEC24CP53992 1094 aa11.63□□□□□ -0.55
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CLIP4-204ENST00000404424 MYL7Q01449 175 aa11.63□□□□□ -0.55
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CLIP4-204ENST00000404424 BFSP1Q12934 665 aa11.63□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 TCEAL1Q15170 157 aa11.63□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 DACT2Q5SW24 774 aa11.63□□□□□ -0.55
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CLIP4-204ENST00000404424 NLGN1Q8N2Q7 840 aa11.63□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 MASTLQ96GX5 879 aa11.63□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 FMO2Q99518 471 aa11.63□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 PFASO15067 1338 aa11.63□□□□□ -0.55
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CLIP4-204ENST00000404424 P4HA2O15460 535 aa11.63□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 TRAPPC3O43617 180 aa11.63□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 GAS7O60861 476 aa11.63□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 GH2P01242 217 aa11.63□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 POLR2MP0CAP2 368 aa11.63□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 ABCB4P21439 1286 aa11.63□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 SETQ01105 290 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 CETN1Q12798 172 aa11.63□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 COG2Q14746 738 aa11.63□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 ODR4Q5SWX8 454 aa11.63□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 DUPD1Q68J44 220 aa11.63□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 TMEM174Q8WUU8 243 aa11.63□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 KAT2BQ92831 832 aa11.63□□□□□ -0.55
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CLIP4-204ENST00000404424 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa11.63□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 CHMP2AO43633 222 aa11.62□□□□□ -0.55
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CLIP4-204ENST00000404424 CYP2J2P51589 502 aa11.62□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 DR1Q01658 176 aa11.62□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 PLCB4Q15147 1175 aa11.62□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 CEP55Q53EZ4 464 aa11.62□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 DCAF12L1Q5VU92 463 aa11.62□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 C6orf89Q6UWU4 347 aa11.62□□□□□ -0.55
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CLIP4-204ENST00000404424 NEK9Q8TD19 979 aa11.62□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 CYFIP2Q96F07 1278 aa11.62□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 AGPAT1Q99943 283 aa11.62□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 DPH5Q9H2P9 285 aa11.62□□□□□ -0.55
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CLIP4-204ENST00000404424 KRT71Q3SY84 523 aa11.62□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 C11orf63Q6NUN7 778 aa11.62□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 HOOK3Q86VS8 718 aa11.62□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 LMO3Q8TAP4 145 aa11.62□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 ATP8B4Q8TF62 1192 aa11.62□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 THAP2Q9H0W7 228 aa11.62□□□□□ -0.55
CLIP4-204ENST00000404424 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa11.62□□□□□ -0.55
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