RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403084.1

CLDN5-201, Transcript of claudin 5, humanhuman

BASIC

Gene CLDN5, Length 2,357 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5-201ENST00000403084 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 SLC30A5Q8TAD4 765 aa23.58■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 OLIG1Q8TAK6 271 aa23.58■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 SLC35G2Q8TBE7 412 aa23.58■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 MGARPQ8TDB4 240 aa23.58■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 RUNDC3BQ96NL0 473 aa23.58■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 PRDM11Q9NQV5 511 aa23.58■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 PCYOX1Q9UHG3 505 aa23.58■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 PODXLO00592 558 aa23.58■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 SMIM24O75264 130 aa23.58■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 CHRNA3P32297 505 aa23.58■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 MECOMQ03112 1051 aa23.58■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 MGAT5Q09328 741 aa23.58■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 SNX1Q13596 522 aa23.58■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 CCDC65Q8IXS2 484 aa23.58■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 GALNT15Q8N3T1 639 aa23.58■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 SIX2Q9NPC8 291 aa23.58■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa23.58■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 PEX11AO75192 247 aa23.57■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 TMEM253P0C7T8 217 aa23.57■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 VCAM1P19320 739 aa23.57■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 CGB2Q6NT52 195 aa23.57■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 STK32AQ8WU08 396 aa23.57■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 ETNK1Q9HBU6 452 aa23.57■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 EMILIN3Q9NT22 766 aa23.57■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 TXLNGQ9NUQ3 528 aa23.57■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 LAMB2P55268 1798 aa23.57■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 ESYT2A0FGR8 921 aa23.57■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 CNGA1P29973 690 aa23.57■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 MXRA7P84157 204 aa23.57■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 EPHA7Q15375 998 aa23.57■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF568Q3ZCX4 644 aa23.57■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 MAEAQ7L5Y9 396 aa23.57■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 CNBD1Q8NA66 436 aa23.57■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 LRMDAQ9H2I8 198 aa23.57■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 CYP39A1Q9NYL5 469 aa23.57■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 KLHL14Q9P2G3 628 aa23.57■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 COL4A1P02462 1669 aa23.57■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 USP17L3A6NCW0 530 aa23.56■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 USP17L4A6NCW7 530 aa23.56■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 EDIL3O43854 480 aa23.56■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 GOLGA8HP0CJ92 632 aa23.56■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 ALAS1P13196 640 aa23.56■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 HSPA6P17066 643 aa23.56■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 GNPTABQ3T906 1256 aa23.56■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.56■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 C18orf8Q96DM3 657 aa23.56■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 TMEM47Q9BQJ4 181 aa23.56■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 TMEM260Q9NX78 707 aa23.56■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 SPDYE5A6NIY4 337 aa23.56■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 TDP2O95551 362 aa23.56■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 KRT13P13646 458 aa23.56■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 NR2F2P24468 414 aa23.56■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 UBE4AQ14139 1066 aa23.56■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 TEKT4Q8WW24 435 aa23.56■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 NLRP3Q96P20 1036 aa23.56■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 SERPINB12Q96P63 405 aa23.56■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 MCM9Q9NXL9 1143 aa23.56■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 UPP2O95045 317 aa23.55■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 USP17L8P0C7I0 530 aa23.55■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 TPBGLP0DKB5 382 aa23.55■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 TUBP50607 506 aa23.55■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 RAD23BP54727 409 aa23.55■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 MTHFD1LQ6UB35 978 aa23.55■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 PIGOQ8TEQ8 1089 aa23.55■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 ART4Q93070 314 aa23.55■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 CPVLQ9H3G5 476 aa23.55■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 MTMR7Q9Y216 660 aa23.55■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 MAST2Q6P0Q8 1798 aa23.55■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 PFASO15067 1338 aa23.55■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 PHLPP1O60346 1717 aa23.55■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 ATP5HO75947 161 aa23.55■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 ACADSP16219 412 aa23.55■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 ATP5DP30049 168 aa23.55■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 CAVIN4Q5BKX8 364 aa23.55■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 C12orf60Q5U649 245 aa23.55■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 ECHDC2Q86YB7 292 aa23.55■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP23.55■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa23.55■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 CTNNA2P26232 953 aa23.54■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 PCK1P35558 622 aa23.54■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 PEX5P50542 639 aa23.54■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 HYIQ5T013 277 aa23.54■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 PRELID2Q8N945 189 aa23.54■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 ALG3Q92685 438 aa23.54■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 GRAMD1AQ96CP6 724 aa23.54■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 SLC4A9Q96Q91 983 aa23.54■■□□□ 1.36
CLDN5-201ENST00000403084 SYT15Q9BQS2 421 aa23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms