RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 DENND3A2RUS2 1198 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 SEPT4O43236 478 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 GAS2O43903 313 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 HMGCRP04035 888 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 HSPA6P17066 643 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 GLRA2P23416 452 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 NR2F2P24468 414 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 GTF2BQ00403 316 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 PPFIA1Q13136 1202 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 ADAM9Q13443 819 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 IER5Q5VY09 327 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 GBP3Q9H0R5 595 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 VPS16Q9H269 839 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 IKZF4Q9H2S9 585 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 COL1A2P08123 1366 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 CETN3O15182 167 aa22.52■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 CLIC2O15247 247 aa22.52■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 TPM2P07951 284 aa22.52■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 RARBP10826 455 aa22.52■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 COPB1P53618 953 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 DRP2Q13474 957 aa22.52■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 EFCAB12Q6NXP0 572 aa22.52■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 RETREG2Q8NC44 543 aa22.52■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 DEPTORQ8TB45 409 aa22.52■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 CEP63Q96MT8 703 aa22.52■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 SPC25Q9HBM1 224 aa22.52■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 H0YCG3 227 aa22.52■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 PES1O00541 588 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 TGFB1I1O43294 461 aa22.52■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 NR3C1P04150 777 aa22.52■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 RPL13P26373 211 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 NAMPTP43490 491 aa22.52■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 DNM2P50570 870 aa22.52■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC40Q4G0X9 1142 aa22.52■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 HVCN1Q96D96 273 aa22.52■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 ZBTB10Q96DT7 871 aa22.52■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 TBX20Q9UMR3 447 aa22.52■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 EXOC7Q9UPT5 735 aa22.52■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.51■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa22.51■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 A0A1B0GTH6 734 aa22.51■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 N4BP3O15049 544 aa22.51■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 C22orf31O95567 290 aa22.51■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 F2P00734 622 aa22.51■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 KLRC1P26715 233 aa22.51■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 GRIK4Q16099 956 aa22.51■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.51■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 SIP14410 1827 aa22.51■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa22.5■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 MAGEB2O15479 319 aa22.5■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 PGK1P00558 417 aa22.5■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 CLCN3P51790 818 aa22.5■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 GJA9P57773 515 aa22.5■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 MFSD10Q14728 455 aa22.5■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 TMC6Q7Z403 805 aa22.5■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.5■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.5■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.5■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa22.5■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 MYADML2A6NDP7 307 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 PSEN2P49810 448 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 CAPSQ13938 189 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 PTPN21Q16825 1174 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 GNASQ5JWF2 1037 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 KAT2BQ92831 832 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 INTS13Q9NVM9 706 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 GNA14O95837 355 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 ABCD1P33897 745 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 PRMT2P55345 433 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 NR1I3Q14994 352 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 CEP135Q66GS9 1140 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 TRIM17Q9Y577 477 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 LRRC10BA6NIK2 292 aa22.48■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.48■■□□□ 1.19
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