RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 GOLGA6L10A6NI86 522 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXD13-201ENST00000392539 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
HOXD13-201ENST00000392539 TNFAIP3P21580 790 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXD13-201ENST00000392539 ATP1A2P50993 1020 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXD13-201ENST00000392539 BFSP1Q12934 665 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXD13-201ENST00000392539 EFCAB13Q8IY85 973 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXD13-201ENST00000392539 EXOC3O60645 756 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXD13-201ENST00000392539 PPP1R37O75864 691 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXD13-201ENST00000392539 HSD17B3P37058 310 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXD13-201ENST00000392539 PPATQ06203 517 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXD13-201ENST00000392539 CEP85LQ5SZL2 805 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXD13-201ENST00000392539 RIT2Q99578 217 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXD13-201ENST00000392539 TMBIM4Q9HC24 238 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXD13-201ENST00000392539 OSGEPQ9NPF4 335 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXD13-201ENST00000392539 HIP1RO75146 1068 aa28.64■■■□□ 2.18
HOXD13-201ENST00000392539 ITGA4P13612 1032 aa28.64■■■□□ 2.18
HOXD13-201ENST00000392539 SUPT20HQ8NEM7 779 aa28.64■■■□□ 2.18
HOXD13-201ENST00000392539 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
HOXD13-201ENST00000392539 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 KIF22Q14807 665 aa28.63■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP28.63■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 FAM151AQ8WW52 585 aa28.63■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 PPM1EQ8WY54 764 aa28.63■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 VCPKMTQ9H867 229 aa28.63■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 KRT13P13646 458 aa28.63■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 MTMR3Q13615 1198 aa28.63■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 MXRA8Q9BRK3 442 aa28.63■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 AMACRQ9UHK6 382 aa28.63■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 MAPK7Q13164 816 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 BANK1Q8NDB2 785 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 SEC14L1Q92503 715 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 VTI1AQ96AJ9 217 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 YDJCA8MPS7 323 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 ZEB2O60315 1214 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 C7orf43Q8WVR3 580 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 FAM114A2Q9NRY5 505 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 ANKRD62A6NC57 917 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 SPDYE2BA6NHP3 402 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 SPDYE6P0CI01 402 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 ABCB4P21439 1286 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 ALCAMQ13740 583 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 PPP2R5EQ16537 467 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 ARHGAP44Q17R89 818 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 LDHDQ86WU2 507 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 NEUROG2Q9H2A3 272 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 FEM1BQ9UK73 627 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 ANKRD65E5RJM6 399 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 H0YGN5 161 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 MYZAPP0CAP1 466 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 BCRP11274 1271 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 PLS1Q14651 629 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 DAW1Q8N136 415 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 DEFB129Q9H1M3 183 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 RABEP2Q9H5N1 569 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 NFS1Q9Y697 457 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 K7ENM7 598 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 NDUFAB1O14561 156 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 PPIP5K2O43314 1243 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 FGGP02679 453 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 MAPTP10636 758 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 CHRNA5P30532 468 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 CLUL1Q15846 466 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 PADI6Q6TGC4 694 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 LMO3Q8TAP4 145 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 HOOK2Q96ED9 719 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 CARD9Q9H257 536 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM206Q9H813 350 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 FAM169AQ9Y6X4 670 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 TTI1O43156 1089 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 DAPK3O43293 454 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 LSP1P33241 339 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 HSPA1LP34931 641 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 CETN1Q12798 172 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 AGPAT1Q99943 283 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 CLRN2A0PK11 232 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 MIER3Q7Z3K6 550 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 RDH13Q8NBN7 331 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM174Q8WUU8 243 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 ARHGEF26Q96DR7 871 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 EPN3Q9H201 632 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 RUFY4Q6ZNE9 571 aa28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms