RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PFKFB2O60825 505 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ENTPD3O75355 529 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PTMAP06454 111 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SF1Q15637 639 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MCTP1Q6DN14 999 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP7Q93009 1102 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BHMTQ93088 406 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PCDHA4Q9UN74 947 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IPPQ9Y573 584 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TIAM2Q8IVF5 1701 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MAST2Q6P0Q8 1798 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PTPDC1A2A3K4 754 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AGRPO00253 132 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GH2P01242 217 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MYL3P08590 195 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GOLGA8HP0CJ92 632 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SHMT1P34896 483 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LIFRP42702 1097 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ECE1P42892 770 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IKQ13123 557 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CUL4AQ13619 759 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SEPT2Q15019 361 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NSMFQ6X4W1 530 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMEM192Q8IY95 271 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NXPE1Q8N323 547 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LRRN4CLQ8ND94 238 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GPBAR1Q8TDU6 330 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BSNDQ8WZ55 320 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FGD4Q96M96 766 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC26A6Q9BXS9 759 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 VAT1LQ9HCJ6 419 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IL17RBQ9NRM6 502 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BRCA2P51587 3418 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PMM2O15305 246 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC26A4O43511 780 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ASGR2P07307 311 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PYGMP11217 842 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PLCG1P19174 1290 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PTMSP20962 102 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HALP42357 657 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM193AP78312 1265 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ST3GAL1Q11201 340 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 INAVAQ3KP66 663 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ABHD17CQ6PCB6 329 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RASGRP2Q7LDG7 609 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AHI1Q8N157 1196 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FANCBQ8NB91 859 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMEM47Q9BQJ4 181 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DNAJC18Q9H819 358 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WDR19Q8NEZ3 1342 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GLTPD2A6NH11 291 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GDF9O60383 454 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EPHX2P34913 555 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ADCYAP1R1P41586 468 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ERVK-21P61565 698 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GABPAQ06546 454 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SEC23AQ15436 765 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCDC96Q2M329 555 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WDR44Q5JSH3 913 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NEDD1Q8NHV4 660 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PAGR1Q9BTK6 254 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AGXT2Q9BYV1 514 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MYH1P12882 1939 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CNTNAP1P78357 1384 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FGFR1P11362 822 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SYT1P21579 422 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C1QTNF8P60827 252 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ICA1Q05084 483 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPEM2Q0P670 501 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCDC178Q5BJE1 867 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM83AQ86UY5 434 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
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