RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345015.4

KCNQ1-203, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene KCNQ1, Length 304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-203ENST00000345015 DRP2Q13474 957 aa13.55□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 TCTN1Q2MV58 587 aa13.55□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 TMEM119Q4V9L6 283 aa13.55□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 CABP7Q86V35 215 aa13.55□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 MYOCDQ8IZQ8 938 aa13.55□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 USP28Q96RU2 1077 aa13.55□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 ZBED2Q9BTP6 218 aa13.55□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 C2orf40Q9H1Z8 148 aa13.55□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 BHMT2Q9H2M3 363 aa13.55□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 TMX1Q9H3N1 280 aa13.55□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 SEMA6BQ9H3T3 888 aa13.55□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF576Q9H609 170 aa13.55□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 GINS2Q9Y248 185 aa13.55□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 CLIC4Q9Y696 253 aa13.55□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 COL6A3P12111 3177 aa13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 A0A0U1RQF3 1178 aa13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 C9IYK1 514 aa13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF623O75123 536 aa13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 NAMPTP43490 491 aa13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 DEFB103AP81534 67 aa13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 ECM1Q16610 540 aa13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 FAM187BQ17R55 369 aa13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 DEFB123Q8N688 67 aa13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 RNF149Q8NC42 400 aa13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 CNNM3Q8NE01 707 aa13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 TMEM143Q96AN5 459 aa13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 DRC1Q96MC2 740 aa13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 SH2D3AQ9BRG2 576 aa13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 OSBPL7Q9BZF2 842 aa13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 FOXD4L1Q9NU39 408 aa13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 TMEM161AQ9NX61 479 aa13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 MTMR10Q9NXD2 777 aa13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 STK17AQ9UEE5 414 aa13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 CCDC39Q9UFE4 941 aa13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 SPTLC2O15270 562 aa13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 USO1O60763 962 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 GLRA2P23416 452 aa13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 NUCB2P80303 420 aa13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 GRB10Q13322 594 aa13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 STK38Q15208 465 aa13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 C1orf186Q6ZWK4 172 aa13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 IFT74Q96LB3 600 aa13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 NLRP4Q96MN2 994 aa13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 ADAM2Q99965 735 aa13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 LMCD1Q9NZU5 365 aa13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 ODF2LQ9ULJ1 636 aa13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 GRXCR1A8MXD5 290 aa13.52□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 H0YCG3 227 aa13.52□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 DGKIO75912 1065 aa13.52□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 RB1P06400 928 aa13.52□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa13.52□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 DDIT3P35638 169 aa13.52□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 SLC12A3P55017 1021 aa13.52□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 ERVK-21P61565 698 aa13.52□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 CAPSQ13938 189 aa13.52□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 NAALADL2Q58DX5 795 aa13.52□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 PPP2R2DQ66LE6 453 aa13.52□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 RINT1Q6NUQ1 792 aa13.52□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa13.52□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 CATSPER4Q7RTX7 472 aa13.52□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa13.52□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 SLC17A8Q8NDX2 589 aa13.52□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 SPIRE2Q8WWL2 714 aa13.52□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 LINC01599Q8WXQ3 324 aa13.52□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 PNMA5Q96PV4 448 aa13.52□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 YME1L1Q96TA2 773 aa13.52□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 CUEDC2Q9H467 287 aa13.52□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 UBN1Q9NPG3 1134 aa13.52□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 RCOR1Q9UKL0 485 aa13.52□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa13.52□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 PTPRSQ13332 1948 aa13.52□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 MYH15Q9Y2K3 1946 aa13.52□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 PP2D1A8MPX8 630 aa13.51□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 CUTAO60888 179 aa13.51□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 ERLIN2O94905 339 aa13.51□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 CA3P07451 260 aa13.51□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 PLA2G4BP0C869 781 aa13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms