RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291574.8

TRAPPC10-201, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 6,976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-201ENST00000291574 NYAP1Q6ZVC0 841 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 THNSL1Q8IYQ7 743 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 EXT2Q93063 718 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 KRT38O76015 456 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 STAT3P40763 770 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 NR1H3Q13133 447 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 PDXDC2PQ6P474 469 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRIM51Q9BSJ1 452 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 VPS11Q9H270 941 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 ERVV-1B6SEH8 477 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 CYP27B1O15528 508 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 INPP1P49441 399 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC13A1Q9BZW2 595 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 PCSK1NQ9UHG2 260 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 BCS1LQ9Y276 419 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 BTBD6Q96KE9 485 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM187AA6NFU0 413 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 LRRC4Q9HBW1 653 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 DCAF15Q66K64 600 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 ORC6Q9Y5N6 252 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 LSP1P33241 339 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 RFFLQ8WZ73 363 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 CEP95Q96GE4 821 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 NCAPGQ9BPX3 1015 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 KLC2Q9H0B6 622 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 PNMA2Q9UL42 364 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 ARHGEF5Q12774 1597 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZBTB5O15062 677 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 DTX3LQ8TDB6 740 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRIM9Q9C026 710 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 SNX25Q9H3E2 840 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 TUBE1Q9UJT0 475 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 ENO4A6NNW6 628 aa14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 USP17L10C9JJH3 530 aa14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 CARSP49589 748 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 BCORL1Q5H9F3 1711 aa14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM196BA6NMK8 535 aa14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC16A4O15374 487 aa14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 CREB3O43889 395 aa14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 CAV1Q03135 178 aa14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 GSTA4O15217 222 aa14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 CHN1P15882 459 aa14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM182BQ5T319 152 aa14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 SPATA21Q7Z572 469 aa14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 SULF1Q8IWU6 871 aa14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMEM35BQ8NCS4 154 aa14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC26A7Q8TE54 656 aa14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 CXorf56Q9H5V9 222 aa14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 F5H423 210 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 GYPCP04921 128 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 PADI6Q6TGC4 694 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 RSPH3Q86UC2 560 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 NDE1Q9NXR1 346 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 BARHL2Q9NY43 387 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 IZUMO3Q5VZ72 239 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 GOLGA8RI6L899 631 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 PLA2G4AP47712 749 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 ALCAMQ13740 583 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM196AQ6ZSG2 479 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 CYFIP2Q96F07 1278 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 NLRP4Q96MN2 994 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 MID2Q9UJV3 735 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 DNAJC6O75061 913 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 Q3C1V9 767 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 TTC25Q96NG3 672 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZIM3Q96PE6 472 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 SERPINB2P05120 415 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 CNGA1P29973 690 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 RABGAP1LQ5R372 815 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 ADSSL1Q8N142 457 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM213AQ9BRX8 229 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 LPXNO60711 386 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 BIRC2Q13490 618 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 ALX1Q15699 326 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 KLHL38Q2WGJ6 581 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 RPS6KC1Q96S38 1066 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms