RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF408Q9H9D4 720 aa26.16■■□□□ 1.78
RPUSD1-201ENST00000007264 AIPL1Q9NZN9 384 aa26.16■■□□□ 1.78
RPUSD1-201ENST00000007264 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
RPUSD1-201ENST00000007264 NEDD9Q14511 834 aa26.15■■□□□ 1.78
RPUSD1-201ENST00000007264 WDR78Q5VTH9 848 aa26.15■■□□□ 1.78
RPUSD1-201ENST00000007264 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
RPUSD1-201ENST00000007264 LACRTQ9GZZ8 138 aa26.15■■□□□ 1.78
RPUSD1-201ENST00000007264 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa26.15■■□□□ 1.78
RPUSD1-201ENST00000007264 TLR2O60603 784 aa26.15■■□□□ 1.78
RPUSD1-201ENST00000007264 ATG7O95352 703 aa26.15■■□□□ 1.78
RPUSD1-201ENST00000007264 KLHL30Q0D2K2 578 aa26.15■■□□□ 1.78
RPUSD1-201ENST00000007264 MTERF2Q49AM1 385 aa26.15■■□□□ 1.78
RPUSD1-201ENST00000007264 XXYLT1Q8NBI6 393 aa26.15■■□□□ 1.78
RPUSD1-201ENST00000007264 LRRN4CLQ8ND94 238 aa26.15■■□□□ 1.78
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa26.15■■□□□ 1.78
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM174Q8WUU8 243 aa26.15■■□□□ 1.78
RPUSD1-201ENST00000007264 SPIRE2Q8WWL2 714 aa26.15■■□□□ 1.78
RPUSD1-201ENST00000007264 FBXL5Q9UKA1 691 aa26.15■■□□□ 1.78
RPUSD1-201ENST00000007264 MYO6Q9UM54 1294 aa26.15■■□□□ 1.78
RPUSD1-201ENST00000007264 TBX20Q9UMR3 447 aa26.15■■□□□ 1.78
RPUSD1-201ENST00000007264 FHOD1Q9Y613 1164 aa26.15■■□□□ 1.78
RPUSD1-201ENST00000007264 RCCD1A6NED2 376 aa26.14■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 TISP43B9A030 160 aa26.14■■□□□ 1.77
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RPUSD1-201ENST00000007264 ELF2Q15723 593 aa26.14■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 GPAT2Q6NUI2 795 aa26.14■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 IFT74Q96LB3 600 aa26.14■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 MMP19Q99542 508 aa26.14■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 CBWD1Q9BRT8 395 aa26.14■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 HSPBP1Q9NZL4 362 aa26.14■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
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RPUSD1-201ENST00000007264 TRIM49P0CI25 452 aa26.13■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 TRIM49CP0CI26 452 aa26.13■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa26.13■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 UBXN4Q92575 508 aa26.13■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 MAP7D2Q96T17 732 aa26.13■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 PNMA3Q9UL41 463 aa26.13■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 OATP04181 439 aa26.13■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 PGK2P07205 417 aa26.13■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 MAGEA1P43355 309 aa26.13■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
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RPUSD1-201ENST00000007264 Q3C1V9 767 aa26.13■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 EEPD1Q7L9B9 569 aa26.13■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 KIFC3Q9BVG8 833 aa26.13■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 MROH8Q9H579 483 aa26.13■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 CDC23Q9UJX2 597 aa26.13■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 MACROD2A1Z1Q3 448 aa26.12■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 EFCAB8A8MWE9 144 aa26.12■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 GJA5P36382 358 aa26.12■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 RTP1P59025 263 aa26.12■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 MYL7Q01449 175 aa26.12■■□□□ 1.77
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RPUSD1-201ENST00000007264 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
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RPUSD1-201ENST00000007264 PDCL2Q8N4E4 241 aa26.11■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
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RPUSD1-201ENST00000007264 CBWD5Q5RIA9 395 aa26.1■■□□□ 1.77
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RPUSD1-201ENST00000007264 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa26.1■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 MAPK13O15264 365 aa26.1■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 GGPS1O95749 300 aa26.1■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 ABCD1P33897 745 aa26.1■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 ERVK-9P63128 1117 aa26.1■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 KCNV1Q6PIU1 500 aa26.1■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC18A3Q16572 532 aa26.09■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 METTL7BQ6UX53 244 aa26.09■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 CEP112Q8N8E3 955 aa26.09■■□□□ 1.77
RPUSD1-201ENST00000007264 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa26.08■■□□□ 1.77
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