RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000165559.1

Ctif-201, Transcript of CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ctif, Length 6,173 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctif-201ENSMUST00000165559 Pcdhb14Q6PB90 796 aa12.81□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Best2Q8BGM5 508 aa12.81□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Krt5Q922U2 580 aa12.81□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Lrp6O88572 1613 aa12.81□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Tcof1O08784 1320 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Pabpc1lA2A5N3 607 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Cyp3a59D3Z2W7 503 aa12.81□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Etv3Q8R4Z4 513 aa12.81□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Arhgef7Q9ES28 862 aa12.81□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Golga5Q9QYE6 729 aa12.81□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 DgkkE9Q7N4 1118 aa12.81□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Zc3h7bF8VPP8 982 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 OatP29758 439 aa12.81□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Nr5a1P33242 462 aa12.81□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Miga1Q4QQM5 600 aa12.81□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Adam39Q7M762 756 aa12.81□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Trnp1Q80ZI1 223 aa12.81□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Klhl11Q8CE33 709 aa12.81□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Pcdhb15Q91Y04 786 aa12.81□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Sh2b2Q9JID9 621 aa12.81□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Eef2kO08796 724 aa12.81□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Mark2Q05512 776 aa12.81□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 E2f8Q58FA4 860 aa12.81□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Mxd3Q80US8 206 aa12.81□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gbp5Q8CFB4 590 aa12.81□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Eif3cQ8R1B4 911 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 ChmQ9QXG2 665 aa12.81□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Slc12a7Q9WVL3 1083 aa12.81□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Cacna2d3Q9Z1L5 1091 aa12.81□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm8882E9Q7E4 283 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Il2P04351 169 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Tsr1Q5SWD9 803 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Impg2Q80XH2 1243 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Slc7a14Q8BXR1 771 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Olfr552E9Q545 317 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Irf6P97431 467 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 EnahQ03173 802 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 P2rx5Q3UYI1 455 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Mief2Q5NCS9 454 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Acat1Q8QZT1 424 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Plekha4Q8VC98 588 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Syap1Q9D5V6 365 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ecel1Q9JMI0 775 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Vmn2r121A2BE32 847 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Lmntd2Q0VET5 664 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Krt26Q3TRJ4 462 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Slc9a2Q3ZAS0 814 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Kansl1lQ5DTI6 991 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Mei4Q8BRM6 389 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Rrp15Q9CYX7 281 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Alox15P39654 663 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Setd4P58467 439 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ppp1r12cQ3UMT1 782 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Cyp7b1Q60991 507 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Cdc23Q8BGZ4 597 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm28042B7ZCM9 1014 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Vmn2r79E9Q067 851 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Usp17ldG5E8G2 545 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Usp17lcG5E8I7 545 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 UncxO08934 530 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 ZbbxQ0P5X5 716 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Zc3h18Q0P678 948 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Best3Q6H1V1 669 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Snx19Q6P4T1 997 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ppfia2Q8BSS9 1257 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Akr1c14Q91WT7 323 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Card14Q99KF0 999 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Apopt1Q9CQW7 192 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Snx29Q9D3S3 818 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa12.8□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Lrriq4A6H6A4 596 aa12.79□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 StrnO55106 780 aa12.79□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Nsun7Q14AW5 724 aa12.79□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Acot5Q6Q2Z6 421 aa12.79□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Nrde2Q80XC6 1172 aa12.79□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Slc8a2Q8K596 921 aa12.79□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Polr3fQ921X6 316 aa12.79□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Snx1Q9WV80 522 aa12.79□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Kiaa0232Q80U59 1396 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ppfia4B8QI36 1187 aa12.79□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Abcb1bP06795 1276 aa12.79□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gad1P48318 593 aa12.79□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Dpcr1Q3TNW5 500 aa12.79□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 AarsQ8BGQ7 968 aa12.79□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Tgs1Q923W1 853 aa12.79□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 1700129C05RikQ9CQ77 218 aa12.79□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Tmed2Q9R0Q3 201 aa12.79□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Phldb3E9QAF4 648 aa12.79□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 PbsnO08976 174 aa12.79□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ift81O35594 676 aa12.79□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Actn4P57780 912 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Cdc14aQ6GQT0 603 aa12.79□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ccdc15Q8C9M2 810 aa12.79□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Cd209bQ8CJ91 325 aa12.79□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gas2l1Q8JZP9 678 aa12.79□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Nek9Q8K1R7 984 aa12.79□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Pdia6Q922R8 440 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ribc1Q9D0B8 379 aa12.79□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Myo1aO88329 1043 aa12.79□□□□□ -0.36
Ctif-201ENSMUST00000165559 Trim72Q1XH17 477 aa12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.5 ms