RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000106039.8

Pkp3-202, Transcript of Plakophilin-3, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp3, Length 2,919 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3-202ENSMUST00000106039 ArcQ9WV31 396 aa14.65□□□□□ -0.06
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Nme9A0A1L1SUL6 329 aa14.65□□□□□ -0.06
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Gm382B1AXN3 1250 aa14.65□□□□□ -0.06
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Rfpl4bJ3QPR6 266 aa14.65□□□□□ -0.06
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Nrg3O35181 713 aa14.65□□□□□ -0.06
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Lilrb3P97484 841 aa14.65□□□□□ -0.06
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Dpcr1Q3TNW5 500 aa14.65□□□□□ -0.06
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Gm5935Q497S0 212 aa14.65□□□□□ -0.06
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Tex21Q9R0U9 575 aa14.65□□□□□ -0.06
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Fxr2Q9WVR4 673 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Gm28036V9GXJ1 658 aa14.65□□□□□ -0.06
Pkp3-202ENSMUST00000106039 PhipQ8VDD9 1821 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Prpmp5E9PXN1 296 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Pgrmc1O55022 195 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Tal1P22091 329 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Mcl1P97287 331 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Rgs9bpQ148R9 237 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Trip13Q3UA06 432 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Xlr3bQ6P205 226 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Herc4Q6PAV2 1057 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Fgd5Q80UZ0 1219 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 HhatQ8BMT9 499 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Fam228aQ8CDW1 299 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Bst2Q8R2Q8 172 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Itm2cQ91VK4 269 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Dr1Q91WV0 176 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 SufuQ9Z0P7 484 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Kiaa1522A2A7S8 1013 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Gm4985A2ALC6 410 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Gm6588E9Q3K0 461 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Kcnh2O35219 1162 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Kif5cP28738 956 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Stxbp3Q60770 592 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Grm4Q68EF4 912 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Dync1li2Q6PDL0 492 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Clca4aQ6Q473 924 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Slc45a1Q8BIV7 751 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Armc6Q8BNU0 468 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 MslnlQ8C160 685 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Bud13Q8R149 637 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Nup58Q8R332 587 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Dnajc19Q9CQV7 116 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Ccnt1Q9QWV9 724 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Slc12a7Q9WVL3 1083 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 A0A286YCQ6 122 aa14.63□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Gcnt1Q09324 428 aa14.63□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Celf4Q7TSY6 486 aa14.63□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Fbxo28Q8BIG4 368 aa14.63□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Rint1Q8BZ36 792 aa14.63□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 GanQ8CA72 597 aa14.63□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Mbtps2Q8CHX6 515 aa14.63□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Ddx25Q9QY15 484 aa14.63□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 DexiQ9WUQ7 95 aa14.63□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Polr2fP61219 127 aa14.63□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Atp8a1P70704 1164 aa14.63□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Wdr70Q3TWF6 657 aa14.63□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Atp13a3Q5XF89 1219 aa14.63□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 A1cfQ5YD48 595 aa14.63□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Sp4Q62445 782 aa14.63□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Calml4Q91WQ9 153 aa14.63□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Sertad2Q9JJG5 309 aa14.63□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Gm5114W4VSN8 858 aa14.63□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Zdbf2Q5SS00 2493 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Tex13c2A0A0G2JGA3 530 aa14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 OatP29758 439 aa14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Eps15P42567 897 aa14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Epb41l4aP52963 686 aa14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Olfm4Q3UZZ4 505 aa14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Elf1Q60775 612 aa14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Dhx37Q6NZL1 1150 aa14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Adam39Q7M762 756 aa14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Arhgef25Q9CWR0 618 aa14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Pacsin2Q9WVE8 486 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Pja1O55176 578 aa14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Tph1P17532 447 aa14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Slc16a10Q3U9N9 512 aa14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Rapgef1Q3UHC1 1224 aa14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Erich4Q3UNU4 136 aa14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Drc1Q3USS3 753 aa14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Krt14Q61781 484 aa14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Gba2Q69ZF3 918 aa14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Thap3Q8BJ25 218 aa14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Gramd4Q8CB44 633 aa14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Ccdc28aQ8CEI3 192 aa14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 SltmQ8CH25 1031 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Plcg2Q8CIH5 1265 aa14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Anapc4Q91W96 807 aa14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Senp2Q91ZX6 588 aa14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Mzb1Q9D8I1 188 aa14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 SerhlQ9EPB5 311 aa14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Capn15Q9JLG8 1095 aa14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Sbf2E9PXF8 1872 aa14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Vmn2r79E9Q067 851 aa14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Speer4f2E9Q366 295 aa14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Ppp1r9aH3BJD6 1292 aa14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Cetn3O35648 167 aa14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 LdhbP16125 334 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Ephb4P54761 987 aa14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Rhbdf1Q6PIX5 856 aa14.62□□□□□ -0.07
Pkp3-202ENSMUST00000106039 Snap47Q8R570 413 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.2 ms