RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000086471.11

Suds3-201, Transcript of Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Suds3, Length 2,425 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tll2Q9WVM6 1012 aa25.22■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm45261A0A1B0GSP6 197 aa25.21■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm4841E9QAA8 417 aa25.21■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cyp2b10P12791 500 aa25.21■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Usp20Q8C6M1 916 aa25.21■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Q9D2Q3 444 aa25.21■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Irf5P56477 497 aa25.21■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Klra9Q2TJJ8 266 aa25.21■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Slc16a10Q3U9N9 512 aa25.21■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Oog4Q4G0C7 502 aa25.21■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pacsin1Q61644 441 aa25.21■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rpn1Q91YQ5 608 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Znf354bQ9QXT9 601 aa25.21■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Slfn14V9GXG1 899 aa25.21■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Serpinc1P32261 465 aa25.2■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 BC051142Q3V0M8 400 aa25.2■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fam189a2Q4FZH1 290 aa25.2■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Psma7Q9Z2U0 248 aa25.2■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Olfr67F8VPJ8 320 aa25.2■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 DtnbO70585 659 aa25.2■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gad1P48318 593 aa25.2■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm3414Q3TNU4 584 aa25.2■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm1587Q3UT80 123 aa25.2■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sh3gl1Q62419 368 aa25.2■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ano5Q75UR0 904 aa25.2■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Plppr4Q7TME0 766 aa25.2■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 WhrnQ80VW5 918 aa25.2■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pknox2Q8BG99 474 aa25.2■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ccdc169Q8BXX9 214 aa25.2■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Kat5Q8CHK4 513 aa25.2■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pcdhac2Q91Y09 1006 aa25.2■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Q91Z58 1206 aa25.2■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pkp2Q9CQ73 795 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nol7Q9D7Z3 254 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Olig1Q9JKN5 260 aa25.2■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Prmt2Q9R144 448 aa25.2■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zbtb12Q9Z150 459 aa25.2■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gcom1E9PZ54 550 aa25.19■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Trdmt1O55055 415 aa25.19■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Map2k1P31938 393 aa25.19■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pou2f2Q00196 463 aa25.19■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 MyzapQ3UIJ9 466 aa25.19■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Kiaa0754Q69ZZ9 979 aa25.19■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sash3Q8K352 380 aa25.19■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tspan8Q8R3G9 235 aa25.19■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dnajc17Q91WT4 303 aa25.19■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pcdhgc5Q91XW9 944 aa25.19■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Asic2Q925H0 512 aa25.19■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 CalcbQ99MP3 130 aa25.19■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Olr1Q9EQ09 363 aa25.19■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sertad2Q9JJG5 309 aa25.19■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 PorcnQ9JJJ7 461 aa25.19■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gfpt2Q9Z2Z9 682 aa25.19■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 GclmO09172 274 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mtco1P00397 514 aa25.18■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fmr1P35922 614 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Il6stQ00560 917 aa25.18■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Lrig2Q52KR2 1054 aa25.18■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zfp397Q7TNK4 527 aa25.18■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cdk17Q8K0D0 523 aa25.18■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Matr3Q8K310 846 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Katnbl1Q9CWJ3 299 aa25.18■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cfap53Q9D439 514 aa25.18■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 4931423N10RikQ9D4J9 382 aa25.18■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Trp53inp1Q9QXE4 239 aa25.18■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 DgkhD3YXJ0 1156 aa25.18■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nr1i3O35627 358 aa25.18■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 3830417A13RikQ8BQJ2 303 aa25.18■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fndc3c1Q6DFV6 1356 aa25.18■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Clca3bE9PUL3 1044 aa25.17■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Clk2O35491 499 aa25.17■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 VegfaQ00731 214 aa25.17■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zcwpw1Q6IR42 630 aa25.17■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Prmt6Q6NZB1 378 aa25.17■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ankfy1Q810B6 1169 aa25.17■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Prpf31Q8CCF0 499 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Plcb4Q91UZ1 1175 aa25.17■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 1700016D06RikQ9DAA5 166 aa25.17■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Lamb2Q61292 1799 aa25.17■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 MafgO54790 162 aa25.17■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cyp11b1Q3TG86 501 aa25.17■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rhox12Q4TU81 186 aa25.17■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 ItgaeQ60677 1167 aa25.17■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Acot11Q8VHQ9 594 aa25.17■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ivns1abpQ920Q8 642 aa25.17■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cdr2lA2A6T1 465 aa25.16■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nploc4P60670 608 aa25.16■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Klra6Q60653 266 aa25.16■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mkrn3Q60764 544 aa25.16■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mapk15Q80Y86 549 aa25.16■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Lmo3Q8BZL8 145 aa25.16■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Srgap2Q91Z67 1071 aa25.16■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cdc42ep4Q9JM96 349 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 OgdhlE9Q7L0 1029 aa25.16■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Guca2bO09051 106 aa25.16■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ano9P86044 747 aa25.16■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ccdc102aQ3TMW1 549 aa25.16■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tmtc1Q3UV71 942 aa25.16■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Arhgap1Q5FWK3 439 aa25.16■■□□□ 1.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 PodnQ7TQ62 611 aa25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.6 ms