RNA–Protein interactions for RNA: YJL097W

PHS1, Transcript of Essential 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase of the ER membrane, yeast

Gene PHS1, Length 654 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PHS1	YJL097W	YDL206W	Q12424	762 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PHS1	YJL097W	YFL066C	P43538	392 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PHS1	YJL097W	RPA14	P50106	137 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PHS1	YJL097W	YPR097W	Q06839	1073 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PHS1	YJL097W	JJJ3	P47138	172 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PHS1	YJL097W	YBL086C	P38177	466 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PHS1	YJL097W	TEA1	P47988	759 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PHS1	YJL097W	ITT1	Q04638	464 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PHS1	YJL097W	PBS2	P08018	668 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PHS1	YJL097W	PUS6	P53294	404 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PHS1	YJL097W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PHS1	YJL097W	TBF1	Q02457	562 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PHS1	YJL097W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PHS1	YJL097W	FPK1	P53739	893 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PHS1	YJL097W	APP1	P53933	587 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PHS1	YJL097W	AI1	P03875	834 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PHS1	YJL097W	SCJ1	P25303	377 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PHS1	YJL097W	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PHS1	YJL097W	VAC17	P25591	423 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PHS1	YJL097W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PHS1	YJL097W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PHS1	YJL097W	YMR196W	Q04336	1088 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHS1	YJL097W	MAM3	Q12296	706 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PHS1	YJL097W	SKN7	P38889	622 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PHS1	YJL097W	CUZ1	P53899	274 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PHS1	YJL097W	IES2	P40154	320 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PHS1	YJL097W	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
PHS1	YJL097W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PHS1	YJL097W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PHS1	YJL097W	DFG5	Q05031	458 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHS1	YJL097W	TDA6	Q06466	467 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHS1	YJL097W	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PHS1	YJL097W	YMR187C	Q03236	431 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PHS1	YJL097W	CEM1	P39525	442 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PHS1	YJL097W	MKS1	P34072	584 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PHS1	YJL097W	CKB1	P43639	278 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PHS1	YJL097W	HST2	P53686	357 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PHS1	YJL097W	MMP1	Q12372	583 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PHS1	YJL097W	DIT2	P21595	489 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PHS1	YJL097W	ESS1	P22696	170 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PHS1	YJL097W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PHS1	YJL097W	SYT1	Q06836	1226 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PHS1	YJL097W	BDS1	Q08347	646 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PHS1	YJL097W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PHS1	YJL097W	YJU3	P28321	313 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PHS1	YJL097W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PHS1	YJL097W	DSF2	P38213	736 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHS1	YJL097W	VTC4	P47075	721 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHS1	YJL097W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PHS1	YJL097W	DAL1	P32375	460 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PHS1	YJL097W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PHS1	YJL097W	YNR014W	P53719	212 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PHS1	YJL097W	STE6	P12866	1290 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PHS1	YJL097W	DIT1	P21623	536 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PHS1	YJL097W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PHS1	YJL097W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PHS1	YJL097W	RSC30	P38781	883 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PHS1	YJL097W	FIG4	P42837	879 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PHS1	YJL097W	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PHS1	YJL097W	MCA1	Q08601	432 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PHS1	YJL097W	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PHS1	YJL097W	FBP26	P32604	452 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PHS1	YJL097W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PHS1	YJL097W	LSB6	P42951	607 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PHS1	YJL097W	MAC1	P35192	417 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PHS1	YJL097W	BOI2	P39969	1040 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PHS1	YJL097W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PHS1	YJL097W	UBP15	P50101	1230 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PHS1	YJL097W	RQC2	Q12532	1038 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PHS1	YJL097W	SLA1	P32790	1244 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PHS1	YJL097W	DMA1	P38823	416 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PHS1	YJL097W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PHS1	YJL097W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PHS1	YJL097W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PHS1	YJL097W	IRC24	P40580	263 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PHS1	YJL097W	ISU1	Q03020	165 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PHS1	YJL097W	YPR084W	Q06821	456 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PHS1	YJL097W	ARG8	P18544	423 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHS1	YJL097W	TAT1	P38085	619 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHS1	YJL097W	SSN3	P39073	555 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHS1	YJL097W	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PHS1	YJL097W	TEC1	P18412	486 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHS1	YJL097W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PHS1	YJL097W	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PHS1	YJL097W	PRY1	P47032	299 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PHS1	YJL097W	YPL034W	Q03083	165 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHS1	YJL097W	ATG20	Q07528	640 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHS1	YJL097W	MSN5	P52918	1224 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PHS1	YJL097W	SAS10	Q12136	610 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PHS1	YJL097W	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PHS1	YJL097W	FPS1	P23900	669 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHS1	YJL097W	OMA1	P36163	345 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PHS1	YJL097W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PHS1	YJL097W	MET1	P36150	593 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHS1	YJL097W	INP52	P50942	1183 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHS1	YJL097W	ATF2	P53296	535 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHS1	YJL097W	WTM2	Q12206	467 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHS1	YJL097W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PHS1	YJL097W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PHS1	YJL097W	GUT2	P32191	649 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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