RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640888.1

LIAS-222, Transcript of lipoic acid synthetase, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIAS, Length 4,041 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LIAS-222	ENST00000640888	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LIAS-222	ENST00000640888	ADGRL1	O94910	1474 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LIAS-222	ENST00000640888	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		13.36	□□□□□ -0.27
LIAS-222	ENST00000640888	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		13.36	□□□□□ -0.27
LIAS-222	ENST00000640888	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		13.36	□□□□□ -0.27
LIAS-222	ENST00000640888	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LIAS-222	ENST00000640888	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
LIAS-222	ENST00000640888	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LIAS-222	ENST00000640888	CD109	Q6YHK3	1445 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LIAS-222	ENST00000640888	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LIAS-222	ENST00000640888	BCAN	Q96GW7	911 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LIAS-222	ENST00000640888	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LIAS-222	ENST00000640888	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
LIAS-222	ENST00000640888	TMC1	Q8TDI8	760 aa		13.3	□□□□□ -0.28
LIAS-222	ENST00000640888	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LIAS-222	ENST00000640888	ABCC1	P33527	1531 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LIAS-222	ENST00000640888	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		13.28	□□□□□ -0.28
LIAS-222	ENST00000640888	FKBP8	Q14318	412 aa		13.28	□□□□□ -0.28
LIAS-222	ENST00000640888	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		13.28	□□□□□ -0.28
LIAS-222	ENST00000640888	RAPGEF3	O95398	923 aa		13.28	□□□□□ -0.28
LIAS-222	ENST00000640888	TMF1	P82094	1093 aa		13.28	□□□□□ -0.28
LIAS-222	ENST00000640888	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LIAS-222	ENST00000640888	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LIAS-222	ENST00000640888	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
LIAS-222	ENST00000640888	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LIAS-222	ENST00000640888	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
LIAS-222	ENST00000640888	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LIAS-222	ENST00000640888	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
LIAS-222	ENST00000640888	PLXNC1	O60486	1568 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LIAS-222	ENST00000640888	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LIAS-222	ENST00000640888	ATP7A	Q04656	1500 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LIAS-222	ENST00000640888	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LIAS-222	ENST00000640888	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
LIAS-222	ENST00000640888	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LIAS-222	ENST00000640888	CDCA8	Q53HL2	280 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LIAS-222	ENST00000640888	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LIAS-222	ENST00000640888	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
LIAS-222	ENST00000640888	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		13.21	□□□□□ -0.3
LIAS-222	ENST00000640888	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.3
LIAS-222	ENST00000640888	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LIAS-222	ENST00000640888	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LIAS-222	ENST00000640888	CCDC184	Q52MB2	194 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LIAS-222	ENST00000640888	STAC3	Q96MF2	364 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LIAS-222	ENST00000640888	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LIAS-222	ENST00000640888	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LIAS-222	ENST00000640888	A2M	P01023	1474 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LIAS-222	ENST00000640888	PLA2R1	Q13018	1463 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LIAS-222	ENST00000640888	MLEC	Q14165	292 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LIAS-222	ENST00000640888	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
LIAS-222	ENST00000640888	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
LIAS-222	ENST00000640888	UNC13B	O14795	1591 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LIAS-222	ENST00000640888	RALBP1	Q15311	655 aa		13.17	□□□□□ -0.3
LIAS-222	ENST00000640888	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		13.17	□□□□□ -0.3
LIAS-222	ENST00000640888	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
LIAS-222	ENST00000640888	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
LIAS-222	ENST00000640888	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
LIAS-222	ENST00000640888	PANK3	Q9H999	370 aa		13.16	□□□□□ -0.3
LIAS-222	ENST00000640888	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		13.15	□□□□□ -0.3
LIAS-222	ENST00000640888	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
LIAS-222	ENST00000640888	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		13.15	□□□□□ -0.3
LIAS-222	ENST00000640888	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LIAS-222	ENST00000640888	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
LIAS-222	ENST00000640888	SLC24A1	O60721	1099 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LIAS-222	ENST00000640888	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LIAS-222	ENST00000640888	ATP10A	O60312	1499 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LIAS-222	ENST00000640888	NLRP13	Q86W25	1043 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LIAS-222	ENST00000640888	KDM5C	P41229	1560 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LIAS-222	ENST00000640888	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LIAS-222	ENST00000640888	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LIAS-222	ENST00000640888	NEO1	Q92859	1461 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LIAS-222	ENST00000640888	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LIAS-222	ENST00000640888	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	13.09	□□□□□ -0.31
LIAS-222	ENST00000640888	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
LIAS-222	ENST00000640888	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
LIAS-222	ENST00000640888	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LIAS-222	ENST00000640888	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LIAS-222	ENST00000640888	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	13.08	□□□□□ -0.32
LIAS-222	ENST00000640888	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LIAS-222	ENST00000640888	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		13.07	□□□□□ -0.32
LIAS-222	ENST00000640888	STK26	Q9P289	416 aa		13.07	□□□□□ -0.32
LIAS-222	ENST00000640888	TESK2	Q96S53	571 aa		13.07	□□□□□ -0.32
LIAS-222	ENST00000640888	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
LIAS-222	ENST00000640888	TRPM2	O94759	1503 aa		13.06	□□□□□ -0.32
LIAS-222	ENST00000640888	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		13.06	□□□□□ -0.32
LIAS-222	ENST00000640888	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		13.06	□□□□□ -0.32
LIAS-222	ENST00000640888	PTPRT	O14522	1441 aa		13.05	□□□□□ -0.32
LIAS-222	ENST00000640888	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
LIAS-222	ENST00000640888	NOS1	P29475	1434 aa		13.04	□□□□□ -0.32
LIAS-222	ENST00000640888	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
LIAS-222	ENST00000640888	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
LIAS-222	ENST00000640888	POGK	Q9P215	609 aa		13.04	□□□□□ -0.32
LIAS-222	ENST00000640888	TET3	O43151	1660 aa		13.04	□□□□□ -0.32
LIAS-222	ENST00000640888	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		13.03	□□□□□ -0.32
LIAS-222	ENST00000640888	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		13.03	□□□□□ -0.32
LIAS-222	ENST00000640888		E9PCH4	1651 aa		13.03	□□□□□ -0.32
LIAS-222	ENST00000640888	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.32
LIAS-222	ENST00000640888	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		13.02	□□□□□ -0.32
LIAS-222	ENST00000640888	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		13.02	□□□□□ -0.32
LIAS-222	ENST00000640888	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		13.02	□□□□□ -0.32
LIAS-222	ENST00000640888	NPAT	Q14207	1427 aa		13.01	□□□□□ -0.33

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