RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637694.1

CNTNAP2-222, Transcript of contactin associated protein like 2, human

TSL 5

Gene CNTNAP2, Length 2,213 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MAP7D2	Q96T17	732 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GRIN2B	Q13224	1484 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HFM1	A2PYH4	1435 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	11.23	□□□□□ -0.61
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MCM4	P33991	863 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DMTN	Q08495	405 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CNTNAP2-222	ENST00000637694	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
CNTNAP2-222	ENST00000637694	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TMC1	Q8TDI8	760 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CNTNAP2-222	ENST00000637694	OFD1	O75665	1012 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PTPRK	Q15262	1439 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		11.21	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TERF1	P54274	439 aa		11.21	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		11.21	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		11.21	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TRAK2	O60296	914 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	BECN1	Q14457	450 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SYNJ2	O15056	1496 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SEC24B	O95487	1268 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ARID3A	Q99856	593 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TMEM51	Q9NW97	253 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PDE3B	Q13370	1112 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NAIP	Q13075	1403 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NLRP1	Q9C000	1473 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TOP2B	Q02880	1626 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ADAMTS12	P58397	1594 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CEP170	Q5SW79	1584 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FMN1	Q68DA7	1419 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CNTNAP2-222	ENST00000637694	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CNTNAP2-222	ENST00000637694	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNTNAP2-222	ENST00000637694	UQCRH	P07919	91 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNTNAP2-222	ENST00000637694	VGLL3	A8MV65	326 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNTNAP2-222	ENST00000637694	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CNTNAP2-222	ENST00000637694	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GRIN2A	Q12879	1464 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CNTNAP2-222	ENST00000637694	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MIA2	Q96PC5	1412 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DYNC1I1	O14576	645 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KIF20A	O95235	890 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HECW1	Q76N89	1606 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KIF15	Q9NS87	1388 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
CNTNAP2-222	ENST00000637694	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KLHL34	Q8N239	644 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CNTNAP2-222	ENST00000637694	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NUP160	Q12769	1436 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZBTB22	O15209	634 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IGHD	P01880	384 aa		11.05	□□□□□ -0.64

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