RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.31■■□□□ 1.64
CTDP1-208ENST00000613122 DRC7Q8IY82 874 aa25.3■■□□□ 1.64
CTDP1-208ENST00000613122 EVC2Q86UK5 1308 aa25.3■■□□□ 1.64
CTDP1-208ENST00000613122 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
CTDP1-208ENST00000613122 SMARCA4P51532 1647 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDP1-208ENST00000613122 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CTDP1-208ENST00000613122 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CTDP1-208ENST00000613122 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CTDP1-208ENST00000613122 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDP1-208ENST00000613122 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDP1-208ENST00000613122 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CTDP1-208ENST00000613122 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.25■■□□□ 1.63
CTDP1-208ENST00000613122 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDP1-208ENST00000613122 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CTDP1-208ENST00000613122 KIF15Q9NS87 1388 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDP1-208ENST00000613122 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDP1-208ENST00000613122 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CTDP1-208ENST00000613122 PANK3Q9H999 370 aa25.22■■□□□ 1.63
CTDP1-208ENST00000613122 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CTDP1-208ENST00000613122 MSH5O43196 834 aa25.21■■□□□ 1.63
CTDP1-208ENST00000613122 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CTDP1-208ENST00000613122 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CTDP1-208ENST00000613122 GBP4Q96PP9 640 aa25.2■■□□□ 1.63
CTDP1-208ENST00000613122 PDE3BQ13370 1112 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDP1-208ENST00000613122 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDP1-208ENST00000613122 TEFQ10587 303 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDP1-208ENST00000613122 TOMM22Q9NS69 142 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDP1-208ENST00000613122 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
CTDP1-208ENST00000613122 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CTDP1-208ENST00000613122 PTMSP20962 102 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDP1-208ENST00000613122 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDP1-208ENST00000613122 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
CTDP1-208ENST00000613122 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDP1-208ENST00000613122 PSME1Q06323 249 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDP1-208ENST00000613122 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC34Q96HJ3 373 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDP1-208ENST00000613122 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CTDP1-208ENST00000613122 MSNP26038 577 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CTDP1-208ENST00000613122 RASSF8Q8NHQ8 419 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDP1-208ENST00000613122 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CTDP1-208ENST00000613122 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDP1-208ENST00000613122 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CTDP1-208ENST00000613122 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDP1-208ENST00000613122 TPM4P67936 248 aa25.08■■□□□ 1.61
CTDP1-208ENST00000613122 ATF3P18847 181 aa25.07■■□□□ 1.6
CTDP1-208ENST00000613122 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CTDP1-208ENST00000613122 NGEFQ8N5V2 710 aa25.07■■□□□ 1.6
CTDP1-208ENST00000613122 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CTDP1-208ENST00000613122 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CTDP1-208ENST00000613122 MARCH6O60337 910 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDP1-208ENST00000613122 VPS53Q5VIR6 699 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDP1-208ENST00000613122 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDP1-208ENST00000613122 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDP1-208ENST00000613122 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CTDP1-208ENST00000613122 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDP1-208ENST00000613122 USP47Q96K76 1375 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDP1-208ENST00000613122 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CTDP1-208ENST00000613122 KIF3AQ9Y496 699 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDP1-208ENST00000613122 KIF16BQ96L93 1317 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDP1-208ENST00000613122 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDP1-208ENST00000613122 E9PSI1 815 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDP1-208ENST00000613122 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
CTDP1-208ENST00000613122 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
CTDP1-208ENST00000613122 RILPL2Q969X0 211 aa24.99■■□□□ 1.59
CTDP1-208ENST00000613122 ST18O60284 1047 aa24.99■■□□□ 1.59
CTDP1-208ENST00000613122 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa24.99■■□□□ 1.59
CTDP1-208ENST00000613122 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CTDP1-208ENST00000613122 BCL2L13Q9BXK5 485 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDP1-208ENST00000613122 IGF1RP08069 1367 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDP1-208ENST00000613122 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CTDP1-208ENST00000613122 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CTDP1-208ENST00000613122 AMOTL1Q8IY63 956 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDP1-208ENST00000613122 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.96■■□□□ 1.59
CTDP1-208ENST00000613122 TRIM34Q9BYJ4 488 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDP1-208ENST00000613122 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
CTDP1-208ENST00000613122 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
CTDP1-208ENST00000613122 PRDM2Q13029 1718 aa24.95■■□□□ 1.58
CTDP1-208ENST00000613122 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDP1-208ENST00000613122 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CTDP1-208ENST00000613122 ANKRD45Q5TZF3 282 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDP1-208ENST00000613122 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CTDP1-208ENST00000613122 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CTDP1-208ENST00000613122 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CTDP1-208ENST00000613122 CHMP4CQ96CF2 233 aa24.92■■□□□ 1.58
CTDP1-208ENST00000613122 FOXD4L1Q9NU39 408 aa24.92■■□□□ 1.58
CTDP1-208ENST00000613122 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
CTDP1-208ENST00000613122 STAC3Q96MF2 364 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDP1-208ENST00000613122 NECTIN2Q92692 538 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDP1-208ENST00000613122 CREBRFQ8IUR6 639 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDP1-208ENST00000613122 RIPK4P57078 832 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDP1-208ENST00000613122 VPS37DQ86XT2 251 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDP1-208ENST00000613122 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDP1-208ENST00000613122 CUX1P39880 1505 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDP1-208ENST00000613122 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.89■■□□□ 1.57
CTDP1-208ENST00000613122 H3BQV1 296 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDP1-208ENST00000613122 IFFO2Q5TF58 517 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDP1-208ENST00000613122 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
CTDP1-208ENST00000613122 APAF1O14727 1248 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDP1-208ENST00000613122 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
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