RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589232.5

GTF3C2-AS1-206, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 254 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa7.01□□□□□ -1.29
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GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ATP7AQ04656 1500 aa6.8□□□□□ -1.32
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DEPDC5O75140 1603 aa6.79□□□□□ -1.32
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GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
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GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CSRNP3Q8WYN3 585 aa6.78□□□□□ -1.32
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GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GGT6Q6P531 493 aa6.77□□□□□ -1.33
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 EHMT2Q96KQ7 1210 aa6.77□□□□□ -1.33
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 UBR1Q8IWV7 1749 aa6.76□□□□□ -1.33
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CREBZFQ9NS37 354 aa6.76□□□□□ -1.33
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