RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578698.1

PTPRM-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 486 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-209ENST00000578698 Q6ZNB5 142 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-209ENST00000578698 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-209ENST00000578698 COL9A1P20849 921 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-209ENST00000578698 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-209ENST00000578698 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-209ENST00000578698 SOWAHBA6NEL2 793 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-209ENST00000578698 TYW1BQ6NUM6 668 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-209ENST00000578698 LAPTM4BQ86VI4 370 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-209ENST00000578698 FBXW7Q969H0 707 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-209ENST00000578698 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-209ENST00000578698 EMILIN3Q9NT22 766 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-209ENST00000578698 KIAA1468Q9P260 1216 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-209ENST00000578698 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-209ENST00000578698 PHF14O94880 888 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-209ENST00000578698 KCNC4Q03721 635 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-209ENST00000578698 MFSD10Q14728 455 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-209ENST00000578698 NYAP1Q6ZVC0 841 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-209ENST00000578698 WBP1LQ9NX94 342 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-209ENST00000578698 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-209ENST00000578698 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-209ENST00000578698 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-209ENST00000578698 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-209ENST00000578698 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-209ENST00000578698 HPS5Q9UPZ3 1129 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-209ENST00000578698 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-209ENST00000578698 LRCH3Q96II8 777 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-209ENST00000578698 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-209ENST00000578698 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-209ENST00000578698 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-209ENST00000578698 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-209ENST00000578698 EPAS1Q99814 870 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-209ENST00000578698 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-209ENST00000578698 VSIG10Q8N0Z9 540 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-209ENST00000578698 DPYSL4O14531 572 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-209ENST00000578698 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-209ENST00000578698 BCANQ96GW7 911 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-209ENST00000578698 LAPTM4AQ15012 233 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-209ENST00000578698 CADPS2Q86UW7 1296 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-209ENST00000578698 DDX12PQ92771 950 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-209ENST00000578698 CFAP44Q96MT7 982 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-209ENST00000578698 GFRA3O60609 400 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-209ENST00000578698 PPP4CP60510 307 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-209ENST00000578698 NBR1Q14596 966 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-209ENST00000578698 PACS2Q86VP3 889 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-209ENST00000578698 MAP3K7O43318 606 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-209ENST00000578698 TRAF7Q6Q0C0 670 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-209ENST00000578698 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-209ENST00000578698 TSKSQ9UJT2 592 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-209ENST00000578698 CAMK2BQ13554 666 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-209ENST00000578698 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-209ENST00000578698 PRKD2Q9BZL6 878 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-209ENST00000578698 SMAPO00193 183 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-209ENST00000578698 LCE2BO14633 110 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-209ENST00000578698 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-209ENST00000578698 SAMD7Q7Z3H4 446 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-209ENST00000578698 RNF40O75150 1001 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-209ENST00000578698 TJAP1Q5JTD0 557 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-209ENST00000578698 MTRQ99707 1265 aa7.34□□□□□ -1.23
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PTPRM-209ENST00000578698 PPP1R18Q6NYC8 613 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-209ENST00000578698 IL21Q9HBE4 155 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-209ENST00000578698 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-209ENST00000578698 CDCA7LQ96GN5 454 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-209ENST00000578698 PNMA3Q9UL41 463 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-209ENST00000578698 NBPF26B4DH59 902 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-209ENST00000578698 PRSS12P56730 875 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-209ENST00000578698 PDIA6Q15084 440 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-209ENST00000578698 V9GY48 417 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-209ENST00000578698 TATDN2Q93075 761 aa7.29□□□□□ -1.24
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PTPRM-209ENST00000578698 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-209ENST00000578698 HDGFP51858 240 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-209ENST00000578698 ZNF516Q92618 1163 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-209ENST00000578698 FAM198AQ9UFP1 575 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-209ENST00000578698 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-209ENST00000578698 GRXCR2A6NFK2 248 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-209ENST00000578698 ZNF787Q6DD87 383 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-209ENST00000578698 CERKQ8TCT0 537 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-209ENST00000578698 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-209ENST00000578698 C3orf80F5H4A9 247 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-209ENST00000578698 NUDT18Q6ZVK8 323 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-209ENST00000578698 GGCXP38435 758 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-209ENST00000578698 APLP1P51693 650 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-209ENST00000578698 COPS2P61201 443 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-209ENST00000578698 NKX2-3Q8TAU0 364 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-209ENST00000578698 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
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PTPRM-209ENST00000578698 NECTIN2Q92692 538 aa7.22□□□□□ -1.25
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PTPRM-209ENST00000578698 SLC4A3P48751 1232 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-209ENST00000578698 E2F4Q16254 413 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-209ENST00000578698 SLF2Q8IX21 1173 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-209ENST00000578698 PADI6Q6TGC4 694 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-209ENST00000578698 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-209ENST00000578698 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-209ENST00000578698 OSBPP22059 807 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-209ENST00000578698 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-209ENST00000578698 WDR70Q9NW82 654 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-209ENST00000578698 ZPR1O75312 459 aa7.16□□□□□ -1.26
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