RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569248.5

STUB1-211, Transcript of STIP1 homology and U-box containing protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene STUB1, Length 1,853 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STUB1-211ENST00000569248 DEPDC5O75140 1603 aa41.27■■■■■ 4.2
STUB1-211ENST00000569248 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.26■■■■■ 4.2
STUB1-211ENST00000569248 ANP32CO43423 234 aa41.26■■■■■ 4.19
STUB1-211ENST00000569248 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.24■■■■■ 4.19
STUB1-211ENST00000569248 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
STUB1-211ENST00000569248 RALGAPBQ86X10 1494 aa41.23■■■■■ 4.19
STUB1-211ENST00000569248 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
STUB1-211ENST00000569248 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
STUB1-211ENST00000569248 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
STUB1-211ENST00000569248 DCAF11Q8TEB1 546 aa41.19■■■■■ 4.18
STUB1-211ENST00000569248 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.19■■■■■ 4.18
STUB1-211ENST00000569248 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
STUB1-211ENST00000569248 KANK1Q14678 1352 aa41.16■■■■■ 4.18
STUB1-211ENST00000569248 CCDC7Q96M83 1385 aa41.15■■■■■ 4.18
STUB1-211ENST00000569248 CCER2I3L3R5 266 aa41.15■■■■■ 4.18
STUB1-211ENST00000569248 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.13■■■■■ 4.17
STUB1-211ENST00000569248 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa41.13■■■■■ 4.17
STUB1-211ENST00000569248 E9PCH4 1651 aa41.12■■■■■ 4.17
STUB1-211ENST00000569248 NEO1Q92859 1461 aa41.12■■■■■ 4.17
STUB1-211ENST00000569248 KDM5CP41229 1560 aa41.12■■■■■ 4.17
STUB1-211ENST00000569248 USP47Q96K76 1375 aa41.12■■■■■ 4.17
STUB1-211ENST00000569248 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.12■■■■■ 4.17
STUB1-211ENST00000569248 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.11■■■■■ 4.17
STUB1-211ENST00000569248 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.11■■■■■ 4.17
STUB1-211ENST00000569248 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.11■■■■■ 4.17
STUB1-211ENST00000569248 TET3O43151 1660 aa41.11■■■■■ 4.17
STUB1-211ENST00000569248 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.11■■■■■ 4.17
STUB1-211ENST00000569248 KIF3BO15066 747 aa41.09■■■■■ 4.17
STUB1-211ENST00000569248 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP41.08■■■■■ 4.17
STUB1-211ENST00000569248 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.07■■■■■ 4.17
STUB1-211ENST00000569248 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.06■■■■■ 4.16
STUB1-211ENST00000569248 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.04■■■■■ 4.16
STUB1-211ENST00000569248 CARD11Q9BXL7 1154 aa41.02■■■■■ 4.16
STUB1-211ENST00000569248 PRAG1Q86YV5 1406 aa41.02■■■■■ 4.16
STUB1-211ENST00000569248 A2MP01023 1474 aa41.02■■■■■ 4.16
STUB1-211ENST00000569248 RGL3Q3MIN7 710 aa41.01■■■■■ 4.16
STUB1-211ENST00000569248 TRPM2O94759 1503 aa41.01■■■■■ 4.16
STUB1-211ENST00000569248 PTPRTO14522 1441 aa41.01■■■■■ 4.16
STUB1-211ENST00000569248 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.01■■■■■ 4.15
STUB1-211ENST00000569248 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa41■■■■■ 4.15
STUB1-211ENST00000569248 MROH1Q8NDA8 1641 aa41■■■■■ 4.15
STUB1-211ENST00000569248 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.99■■■■■ 4.15
STUB1-211ENST00000569248 GLI2P10070 1586 aa40.99■■■■■ 4.15
STUB1-211ENST00000569248 KIF7Q2M1P5 1343 aa40.99■■■■■ 4.15
STUB1-211ENST00000569248 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa40.97■■■■■ 4.15
STUB1-211ENST00000569248 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.96■■■■■ 4.15
STUB1-211ENST00000569248 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
STUB1-211ENST00000569248 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
STUB1-211ENST00000569248 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.91■■■■■ 4.14
STUB1-211ENST00000569248 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa40.91■■■■■ 4.14
STUB1-211ENST00000569248 CEP152O94986 1710 aa40.9■■■■■ 4.14
STUB1-211ENST00000569248 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.87■■■■■ 4.13
STUB1-211ENST00000569248 LAMC1P11047 1609 aa40.84■■■■■ 4.13
STUB1-211ENST00000569248 GPRASP1Q5JY77 1395 aa40.84■■■■■ 4.13
STUB1-211ENST00000569248 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.83■■■■■ 4.13
STUB1-211ENST00000569248 STAC3Q96MF2 364 aa40.83■■■■■ 4.13
STUB1-211ENST00000569248 CLTCL1P53675 1640 aa40.83■■■■■ 4.13
STUB1-211ENST00000569248 ABCA6Q8N139 1617 aa40.83■■■■■ 4.13
STUB1-211ENST00000569248 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.83■■■■■ 4.13
STUB1-211ENST00000569248 RICTORQ6R327 1708 aa40.79■■■■■ 4.12
STUB1-211ENST00000569248 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.78■■■■■ 4.12
STUB1-211ENST00000569248 RAPGEF3O95398 923 aa40.78■■■■■ 4.12
STUB1-211ENST00000569248 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa40.77■■■■■ 4.12
STUB1-211ENST00000569248 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.74■■■■■ 4.11
STUB1-211ENST00000569248 DIP2BQ9P265 1576 aa40.74■■■■■ 4.11
STUB1-211ENST00000569248 NBPF1Q3BBV0 1214 aa40.71■■■■■ 4.11
STUB1-211ENST00000569248 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.7■■■■■ 4.11
STUB1-211ENST00000569248 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.7■■■■■ 4.11
STUB1-211ENST00000569248 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
STUB1-211ENST00000569248 MADDQ8WXG6 1647 aa40.66■■■■■ 4.1
STUB1-211ENST00000569248 KIF1BO60333 1816 aa40.65■■■■■ 4.1
STUB1-211ENST00000569248 GGT6Q6P531 493 aa40.64■■■■■ 4.1
STUB1-211ENST00000569248 POLR3GLQ9BT43 218 aa40.62■■■■■ 4.09
STUB1-211ENST00000569248 ABCC3O15438 1527 aa40.57■■■■■ 4.09
STUB1-211ENST00000569248 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa40.56■■■■■ 4.08
STUB1-211ENST00000569248 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.55■■■■■ 4.08
STUB1-211ENST00000569248 NPATQ14207 1427 aa40.55■■■■■ 4.08
STUB1-211ENST00000569248 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.54■■■■■ 4.08
STUB1-211ENST00000569248 TSPOAP1O95153 1857 aa40.51■■■■■ 4.07
STUB1-211ENST00000569248 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.5■■■■■ 4.07
STUB1-211ENST00000569248 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa40.5■■■■■ 4.07
STUB1-211ENST00000569248 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa40.49■■■■■ 4.07
STUB1-211ENST00000569248 MYOM2P54296 1465 aa40.49■■■■■ 4.07
STUB1-211ENST00000569248 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP40.46■■■■■ 4.07
STUB1-211ENST00000569248 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
STUB1-211ENST00000569248 TESK2Q96S53 571 aa40.45■■■■■ 4.07
STUB1-211ENST00000569248 IFT172Q9UG01 1749 aa40.44■■■■■ 4.07
STUB1-211ENST00000569248 IQGAP1P46940 1657 aa40.44■■■■■ 4.06
STUB1-211ENST00000569248 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
STUB1-211ENST00000569248 ADGRB3O60242 1522 aa40.42■■■■■ 4.06
STUB1-211ENST00000569248 MROH2AA6NES4 1674 aa40.42■■■■■ 4.06
STUB1-211ENST00000569248 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.39■■■■■ 4.06
STUB1-211ENST00000569248 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.05
STUB1-211ENST00000569248 TMF1P82094 1093 aa40.37■■■■■ 4.05
STUB1-211ENST00000569248 NOS1P29475 1434 aa40.37■■■■■ 4.05
STUB1-211ENST00000569248 MRS2Q9HD23 443 aa40.35■■■■■ 4.05
STUB1-211ENST00000569248 CCDC184Q52MB2 194 aa40.34■■■■■ 4.05
STUB1-211ENST00000569248 NRXN1Q9ULB1 1477 aa40.32■■■■■ 4.05
STUB1-211ENST00000569248 DISP3Q9P2K9 1392 aa40.31■■■■■ 4.04
STUB1-211ENST00000569248 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.31■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms