RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
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USP3-AS1-204ENST00000559861 ADAM33Q9BZ11 813 aa17.29■□□□□ 0.36
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USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF687Q8N1G0 1237 aa17.2■□□□□ 0.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 CDHR5Q9HBB8 845 aa17.18■□□□□ 0.34
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USP3-AS1-204ENST00000559861 KCNH8Q96L42 1107 aa17.1■□□□□ 0.33
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USP3-AS1-204ENST00000559861 HIC1Q14526 733 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-204ENST00000559861 TPRNQ4KMQ1 711 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-204ENST00000559861 AXIN2Q9Y2T1 843 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZMYND10O75800 440 aa17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-204ENST00000559861 SMARCA4P51532 1647 aa17.05■□□□□ 0.32
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USP3-AS1-204ENST00000559861 SMARCA2P51531 1590 aa17.02■□□□□ 0.31
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRSS12P56730 875 aa17■□□□□ 0.31
USP3-AS1-204ENST00000559861 DMRTA1Q5VZB9 504 aa17■□□□□ 0.31
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USP3-AS1-204ENST00000559861 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP16.94■□□□□ 0.3
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USP3-AS1-204ENST00000559861 PROX2Q3B8N5 592 aa16.93■□□□□ 0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 CDAN1Q8IWY9 1227 aa16.93■□□□□ 0.3
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USP3-AS1-204ENST00000559861 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa16.93■□□□□ 0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa16.92■□□□□ 0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 TSKSQ9UJT2 592 aa16.92■□□□□ 0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 MAP2K5Q13163 448 aa16.91■□□□□ 0.3
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USP3-AS1-204ENST00000559861 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa16.9■□□□□ 0.3
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USP3-AS1-204ENST00000559861 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.88■□□□□ 0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.87■□□□□ 0.29
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USP3-AS1-204ENST00000559861 IRF6O14896 467 aa16.86■□□□□ 0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 PACS2Q86VP3 889 aa16.86■□□□□ 0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 RABGEF1Q9UJ41 708 aa16.86■□□□□ 0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 ADGRD1Q6QNK2 874 aa16.85■□□□□ 0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC24A3Q9HC58 644 aa16.84■□□□□ 0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 KIAA1468Q9P260 1216 aa16.84■□□□□ 0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 ADGRG1Q9Y653 693 aa16.84■□□□□ 0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa16.83■□□□□ 0.28
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCDC102AQ96A19 550 aa16.81■□□□□ 0.28
USP3-AS1-204ENST00000559861 NBPF26B4DH59 902 aa16.8■□□□□ 0.28
USP3-AS1-204ENST00000559861 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
USP3-AS1-204ENST00000559861 C3orf80F5H4A9 247 aa16.79■□□□□ 0.28
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM161AQ3B820 660 aa16.79■□□□□ 0.28
USP3-AS1-204ENST00000559861 TATDN2Q93075 761 aa16.79■□□□□ 0.28
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCDH10Q9P2E7 1040 aa16.79■□□□□ 0.28
USP3-AS1-204ENST00000559861 OATP04181 439 aa16.78■□□□□ 0.28
USP3-AS1-204ENST00000559861 AK7Q96M32 723 aa16.78■□□□□ 0.28
USP3-AS1-204ENST00000559861 HRO43593 1189 aa16.77■□□□□ 0.28
USP3-AS1-204ENST00000559861 NUDT18Q6ZVK8 323 aa16.76■□□□□ 0.27
USP3-AS1-204ENST00000559861 EYA1Q99502 592 aa16.76■□□□□ 0.27
USP3-AS1-204ENST00000559861 PNMA3Q9UL41 463 aa16.76■□□□□ 0.27
USP3-AS1-204ENST00000559861 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
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