RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.26■■□□□ 1.95
AFG3L1P-217ENST00000557444 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
AFG3L1P-217ENST00000557444 SHROOM2Q13796 1616 aa27.24■■□□□ 1.95
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.22■■□□□ 1.95
AFG3L1P-217ENST00000557444 PLA2R1Q13018 1463 aa27.21■■□□□ 1.95
AFG3L1P-217ENST00000557444 NBPF1Q3BBV0 1214 aa27.19■■□□□ 1.94
AFG3L1P-217ENST00000557444 PPP4R2Q9NY27 417 aa27.19■■□□□ 1.94
AFG3L1P-217ENST00000557444 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.19■■□□□ 1.94
AFG3L1P-217ENST00000557444 ABCC2Q92887 1545 aa27.18■■□□□ 1.94
AFG3L1P-217ENST00000557444 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.17■■□□□ 1.94
AFG3L1P-217ENST00000557444 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa27.17■■□□□ 1.94
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMC1Q8TDI8 760 aa27.16■■□□□ 1.94
AFG3L1P-217ENST00000557444 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.16■■□□□ 1.94
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.15■■□□□ 1.94
AFG3L1P-217ENST00000557444 ERICH6BQ5W0A0 696 aa27.15■■□□□ 1.94
AFG3L1P-217ENST00000557444 UNC13BO14795 1591 aa27.15■■□□□ 1.94
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.13■■□□□ 1.93
AFG3L1P-217ENST00000557444 ANP32EQ9BTT0 268 aa27.13■■□□□ 1.93
AFG3L1P-217ENST00000557444 A2MP01023 1474 aa27.11■■□□□ 1.93
AFG3L1P-217ENST00000557444 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
AFG3L1P-217ENST00000557444 PLXNC1O60486 1568 aa27.08■■□□□ 1.93
AFG3L1P-217ENST00000557444 NUDCQ9Y266 331 aa27.08■■□□□ 1.93
AFG3L1P-217ENST00000557444 E9PCH4 1651 aa27.07■■□□□ 1.92
AFG3L1P-217ENST00000557444 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.07■■□□□ 1.92
AFG3L1P-217ENST00000557444 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
AFG3L1P-217ENST00000557444 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.03■■□□□ 1.92
AFG3L1P-217ENST00000557444 PLCH2O75038 1416 aa27.03■■□□□ 1.92
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.02■■□□□ 1.92
AFG3L1P-217ENST00000557444 RALBP1Q15311 655 aa27.01■■□□□ 1.92
AFG3L1P-217ENST00000557444 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.01■■□□□ 1.91
AFG3L1P-217ENST00000557444 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
AFG3L1P-217ENST00000557444 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
AFG3L1P-217ENST00000557444 GPRASP1Q5JY77 1395 aa27■■□□□ 1.91
AFG3L1P-217ENST00000557444 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.99■■□□□ 1.91
AFG3L1P-217ENST00000557444 MSH5O43196 834 aa26.98■■□□□ 1.91
AFG3L1P-217ENST00000557444 TESK2Q96S53 571 aa26.98■■□□□ 1.91
AFG3L1P-217ENST00000557444 ERBINQ96RT1 1412 aa26.97■■□□□ 1.91
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.97■■□□□ 1.91
AFG3L1P-217ENST00000557444 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
AFG3L1P-217ENST00000557444 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
AFG3L1P-217ENST00000557444 AFAP1Q8N556 730 aa26.95■■□□□ 1.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 ABCC1P33527 1531 aa26.95■■□□□ 1.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.94■■□□□ 1.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 PARD3Q8TEW0 1356 aa26.93■■□□□ 1.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.93■■□□□ 1.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 ATP10AO60312 1499 aa26.92■■□□□ 1.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 NLRP13Q86W25 1043 aa26.9■■□□□ 1.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 PANK3Q9H999 370 aa26.89■■□□□ 1.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.88■■□□□ 1.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 LAMC1P11047 1609 aa26.88■■□□□ 1.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.85■■□□□ 1.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMF1P82094 1093 aa26.84■■□□□ 1.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC136Q96JN2 1154 aa26.82■■□□□ 1.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.81■■□□□ 1.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 MADDQ8WXG6 1647 aa26.76■■□□□ 1.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.76■■□□□ 1.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.75■■□□□ 1.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.74■■□□□ 1.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRPM2O94759 1503 aa26.73■■□□□ 1.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.73■■□□□ 1.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 CLTCL1P53675 1640 aa26.72■■□□□ 1.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.71■■□□□ 1.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.71■■□□□ 1.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 FANCAO15360 1455 aa26.71■■□□□ 1.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.71■■□□□ 1.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 KIF3BO15066 747 aa26.7■■□□□ 1.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 PTPRTO14522 1441 aa26.69■■□□□ 1.86
AFG3L1P-217ENST00000557444 CEP152O94986 1710 aa26.69■■□□□ 1.86
AFG3L1P-217ENST00000557444 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.68■■□□□ 1.86
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.68■■□□□ 1.86
AFG3L1P-217ENST00000557444 ATP7AQ04656 1500 aa26.68■■□□□ 1.86
AFG3L1P-217ENST00000557444 IQGAP1P46940 1657 aa26.67■■□□□ 1.86
AFG3L1P-217ENST00000557444 DEPDC5O75140 1603 aa26.67■■□□□ 1.86
AFG3L1P-217ENST00000557444 EXOC6Q8TAG9 804 aa26.67■■□□□ 1.86
AFG3L1P-217ENST00000557444 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.64■■□□□ 1.85
AFG3L1P-217ENST00000557444 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.85
AFG3L1P-217ENST00000557444 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.85
AFG3L1P-217ENST00000557444 TET3O43151 1660 aa26.63■■□□□ 1.85
AFG3L1P-217ENST00000557444 PDE3BQ13370 1112 aa26.63■■□□□ 1.85
AFG3L1P-217ENST00000557444 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.63■■□□□ 1.85
AFG3L1P-217ENST00000557444 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.63■■□□□ 1.85
AFG3L1P-217ENST00000557444 ADGRL1O94910 1474 aa26.62■■□□□ 1.85
AFG3L1P-217ENST00000557444 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
AFG3L1P-217ENST00000557444 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.61■■□□□ 1.85
AFG3L1P-217ENST00000557444 KANK1Q14678 1352 aa26.61■■□□□ 1.85
AFG3L1P-217ENST00000557444 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.6■■□□□ 1.85
AFG3L1P-217ENST00000557444 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
AFG3L1P-217ENST00000557444 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.58■■□□□ 1.85
AFG3L1P-217ENST00000557444 PLIN1O60240 522 aa26.58■■□□□ 1.85
AFG3L1P-217ENST00000557444 PPP2R1AP30153 589 aa26.58■■□□□ 1.85
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