RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552963.5

GRASP-208, Transcript of general receptor for phosphoinositides 1 associated scaffold protein, human

TSL 1 (best)

Gene GRASP, Length 1,634 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRASP-208	ENST00000552963	DIP2B	Q9P265	1576 aa		43.01	■■■■■ 4.48
GRASP-208	ENST00000552963	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	43	■■■■■ 4.47
GRASP-208	ENST00000552963	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		43	■■■■■ 4.47
GRASP-208	ENST00000552963	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		42.99	■■■■■ 4.47
GRASP-208	ENST00000552963	ATP10A	O60312	1499 aa		42.93	■■■■■ 4.46
GRASP-208	ENST00000552963	KANK1	Q14678	1352 aa		42.91	■■■■■ 4.46
GRASP-208	ENST00000552963	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		42.89	■■■■■ 4.46
GRASP-208	ENST00000552963	A2M	P01023	1474 aa		42.88	■■■■■ 4.46
GRASP-208	ENST00000552963	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	42.88	■■■■■ 4.45
GRASP-208	ENST00000552963	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		42.87	■■■■■ 4.45
GRASP-208	ENST00000552963	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		42.85	■■■■■ 4.45
GRASP-208	ENST00000552963	TET3	O43151	1660 aa		42.83	■■■■■ 4.45
GRASP-208	ENST00000552963	RICTOR	Q6R327	1708 aa		42.83	■■■■■ 4.45
GRASP-208	ENST00000552963	PLA2R1	Q13018	1463 aa		42.8	■■■■■ 4.44
GRASP-208	ENST00000552963	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		42.79	■■■■■ 4.44
GRASP-208	ENST00000552963	KIF3B	O15066	747 aa		42.79	■■■■■ 4.44
GRASP-208	ENST00000552963	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	42.79	■■■■■ 4.44
GRASP-208	ENST00000552963	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		42.77	■■■■■ 4.44
GRASP-208	ENST00000552963	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		42.76	■■■■■ 4.44
GRASP-208	ENST00000552963		E9PCH4	1651 aa		42.75	■■■■■ 4.43
GRASP-208	ENST00000552963	ABCA6	Q8N139	1617 aa		42.75	■■■■■ 4.43
GRASP-208	ENST00000552963	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		42.72	■■■■■ 4.43
GRASP-208	ENST00000552963	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		42.72	■■■■■ 4.43
GRASP-208	ENST00000552963	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		42.69	■■■■■ 4.42
GRASP-208	ENST00000552963	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	42.69	■■■■■ 4.42
GRASP-208	ENST00000552963	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	42.69	■■■■■ 4.42
GRASP-208	ENST00000552963	RAPGEF3	O95398	923 aa		42.68	■■■■■ 4.42
GRASP-208	ENST00000552963	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		42.67	■■■■■ 4.42
GRASP-208	ENST00000552963	TRPM2	O94759	1503 aa		42.67	■■■■■ 4.42
GRASP-208	ENST00000552963	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		42.66	■■■■■ 4.42
GRASP-208	ENST00000552963	PTPRT	O14522	1441 aa		42.66	■■■■■ 4.42
GRASP-208	ENST00000552963	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		42.64	■■■■■ 4.42
GRASP-208	ENST00000552963	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		42.59	■■■■■ 4.41
GRASP-208	ENST00000552963	TSPOAP1	O95153	1857 aa		42.59	■■■■■ 4.41
GRASP-208	ENST00000552963	MIER1	Q8N108	512 aa		42.59	■■■■■ 4.41
GRASP-208	ENST00000552963	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	42.58	■■■■■ 4.41
GRASP-208	ENST00000552963	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		42.58	■■■■■ 4.41
GRASP-208	ENST00000552963	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		42.58	■■■■■ 4.41
GRASP-208	ENST00000552963	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	42.53	■■■■■ 4.4
GRASP-208	ENST00000552963	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		42.51	■■■■■ 4.4
GRASP-208	ENST00000552963	CEP152	O94986	1710 aa		42.5	■■■■■ 4.39
GRASP-208	ENST00000552963	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		42.48	■■■■■ 4.39
GRASP-208	ENST00000552963	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		42.48	■■■■■ 4.39
GRASP-208	ENST00000552963	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	42.45	■■■■■ 4.39
GRASP-208	ENST00000552963	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		42.44	■■■■■ 4.39
GRASP-208	ENST00000552963	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		42.44	■■■■■ 4.38
GRASP-208	ENST00000552963	CLTCL1	P53675	1640 aa		42.43	■■■■■ 4.38
GRASP-208	ENST00000552963	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		42.43	■■■■■ 4.38
GRASP-208	ENST00000552963	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	42.42	■■■■■ 4.38
GRASP-208	ENST00000552963	STAC3	Q96MF2	364 aa		42.41	■■■■■ 4.38
GRASP-208	ENST00000552963	RERE	Q9P2R6	1566 aa		42.4	■■■■■ 4.38
GRASP-208	ENST00000552963	ABCC3	O15438	1527 aa		42.4	■■■■■ 4.38
GRASP-208	ENST00000552963	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		42.39	■■■■■ 4.38
GRASP-208	ENST00000552963	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	42.39	■■■■■ 4.38
GRASP-208	ENST00000552963	RGL3	Q3MIN7	710 aa		42.37	■■■■■ 4.37
GRASP-208	ENST00000552963	GGT6	Q6P531	493 aa		42.37	■■■■■ 4.37
GRASP-208	ENST00000552963	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		42.35	■■■■■ 4.37
GRASP-208	ENST00000552963	USP47	Q96K76	1375 aa		42.34	■■■■■ 4.37
GRASP-208	ENST00000552963	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	42.32	■■■■■ 4.37
GRASP-208	ENST00000552963	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		42.31	■■■■■ 4.36
GRASP-208	ENST00000552963	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		42.31	■■■■■ 4.36
GRASP-208	ENST00000552963	NPAT	Q14207	1427 aa		42.28	■■■■■ 4.36
GRASP-208	ENST00000552963	LAMC1	P11047	1609 aa		42.28	■■■■■ 4.36
GRASP-208	ENST00000552963	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		42.28	■■■■■ 4.36
GRASP-208	ENST00000552963	AGL	P35573	1532 aa		42.27	■■■■■ 4.36
GRASP-208	ENST00000552963	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		42.27	■■■■■ 4.36
GRASP-208	ENST00000552963	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		42.27	■■■■■ 4.36
GRASP-208	ENST00000552963	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	42.26	■■■■■ 4.36
GRASP-208	ENST00000552963	KIF1B	O60333	1816 aa		42.26	■■■■■ 4.36
GRASP-208	ENST00000552963	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		42.25	■■■■■ 4.35
GRASP-208	ENST00000552963	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		42.25	■■■■■ 4.35
GRASP-208	ENST00000552963	CCDC7	Q96M83	1385 aa		42.22	■■■■■ 4.35
GRASP-208	ENST00000552963	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		42.18	■■■■■ 4.34
GRASP-208	ENST00000552963	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	42.17	■■■■■ 4.34
GRASP-208	ENST00000552963	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		42.17	■■■■■ 4.34
GRASP-208	ENST00000552963	MADD	Q8WXG6	1647 aa		42.16	■■■■■ 4.34
GRASP-208	ENST00000552963	NOS1	P29475	1434 aa		42.14	■■■■■ 4.34
GRASP-208	ENST00000552963	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	42.12	■■■■■ 4.33
GRASP-208	ENST00000552963	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		42.12	■■■■■ 4.33
GRASP-208	ENST00000552963	MYOM2	P54296	1465 aa		42.1	■■■■■ 4.33
GRASP-208	ENST00000552963	ADGRB3	O60242	1522 aa		42.1	■■■■■ 4.33
GRASP-208	ENST00000552963	ANP32C	O43423	234 aa		42.09	■■■■■ 4.33
GRASP-208	ENST00000552963	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		42.06	■■■■■ 4.32
GRASP-208	ENST00000552963	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	42.06	■■■■■ 4.32
GRASP-208	ENST00000552963	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		42.05	■■■■■ 4.32
GRASP-208	ENST00000552963	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	42.04	■■■■■ 4.32
GRASP-208	ENST00000552963	IFT172	Q9UG01	1749 aa		42.04	■■■■■ 4.32
GRASP-208	ENST00000552963	PIK3C2B	O00750	1634 aa		42.03	■■■■■ 4.32
GRASP-208	ENST00000552963	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		42.03	■■■■■ 4.32
GRASP-208	ENST00000552963	MROH2A	A6NES4	1674 aa		42.02	■■■■■ 4.32
GRASP-208	ENST00000552963	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	42	■■■■■ 4.31
GRASP-208	ENST00000552963	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		41.98	■■■■■ 4.31
GRASP-208	ENST00000552963	SYNM	O15061	1565 aa		41.98	■■■■■ 4.31
GRASP-208	ENST00000552963	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		41.95	■■■■■ 4.31
GRASP-208	ENST00000552963	CCER2	I3L3R5	266 aa		41.95	■■■■■ 4.31
GRASP-208	ENST00000552963	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		41.95	■■■■■ 4.31
GRASP-208	ENST00000552963	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		41.93	■■■■■ 4.3
GRASP-208	ENST00000552963	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		41.92	■■■■■ 4.3
GRASP-208	ENST00000552963	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		41.91	■■■■■ 4.3
GRASP-208	ENST00000552963	PPL	O60437	1756 aa		41.87	■■■■■ 4.29

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms