RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
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PTPRB-208ENST00000550358 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
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PTPRB-208ENST00000550358 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-208ENST00000550358 ROCK1Q13464 1354 aa10.67□□□□□ -0.7
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PTPRB-208ENST00000550358 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
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PTPRB-208ENST00000550358 TOP2BQ02880 1626 aa10.64□□□□□ -0.71
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PTPRB-208ENST00000550358 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
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PTPRB-208ENST00000550358 KIAA2012Q0VF49 1180 aa10.62□□□□□ -0.71
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PTPRB-208ENST00000550358 PRDM2Q13029 1718 aa10.62□□□□□ -0.71
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PTPRB-208ENST00000550358 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRB-208ENST00000550358 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP10.59□□□□□ -0.71
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PTPRB-208ENST00000550358 POGZQ7Z3K3 1410 aa10.58□□□□□ -0.72
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PTPRB-208ENST00000550358 GNAI1P63096 354 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRB-208ENST00000550358 PSME1Q06323 249 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRB-208ENST00000550358 FAM69CQ0P6D2 419 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRB-208ENST00000550358 DDX11L8A8MPP1 907 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRB-208ENST00000550358 RUNDC1Q96C34 613 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRB-208ENST00000550358 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PTPRB-208ENST00000550358 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRB-208ENST00000550358 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
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